Extracto
Antecedentes
Los microARN (miRNA) son ampliamente estudiados los ARN no codificantes que modulan la expresión génica. MiRNAs están desreguladas en diferentes tumores, incluyendo el cáncer gástrico (CG) y tienen potenciales implicaciones diagnósticas y pronósticas. El objetivo de nuestro estudio fue determinar el perfil de miARN en los tejidos GC, seguido de evaluación de miRNAs desregulados en el plasma de pacientes con cáncer gástrico. El uso de bases de datos disponibles y los métodos bioinformáticos que también tuvo como objetivo evaluar los posibles genes diana de confirmado diferencialmente expresado miARN y validar estos hallazgos en los tejidos GC.
Métodos
En el estudio participaron 51 pacientes y 51 controles de GC. Inicialmente, hemos examinado miARN perfil de expresión en 13 muestras de tejido de GC y 12 tejidos gástricos normales con matriz de baja densidad TaqMan (TLDA). En la segunda etapa, los miRNAs expresados diferencialmente fueron validados en una cohorte de replicación mediante QRT-PCR en muestras de tejido y plasma. Posteriormente, se analizaron los posibles genes diana de miRNAs desregulados utilizando enfoque de la bioinformática, determinamos su expresión en tejidos GC y se realizó un análisis de correlación con la orientación miRNAs.
Resultados
Perfilado con TLDA reveló 15 miRNAs desregulados en GC tejidos en comparación con la mucosa gástrica normal. El análisis confirmó que la replicación de miR-148a-3p, miR-204-5p, miR-223-3p y miR-375 fueron desregulados consistentemente en los tejidos GC. Análisis de muestras de plasma de pacientes GC mostró significativa baja regulación de miR-148a-3p, miR-375 y sobre regulación de miR-223-3p en comparación con sujetos sanos. Además, el uso de herramientas bioinformáticas se identificaron objetivos de miRNAs replicadas y se realizó un análisis de enriquecimiento de genes asociados con la enfermedad. En última instancia, se evaluó el potencial gen diana
BCL2
y
DNMT3B
expresión de QRT-PCR en el tejido GC, lo que se correlaciona con la expresión de orientación miARN.
Conclusiones
Nuestro estudio reveló perfil miARN en los tejidos GC y mostró que el miR-148a-3p, miR-223-3p y miR-375 están desreguladas en muestras de plasma de GC, pero estos miRNAs circulantes mostró rendimiento diagnóstico relativamente débil como biomarcadores únicos. El análisis del gen diana demostró que
BCL2
y
DNMT3B
expresión en tejido GC correlacionado con su expresión de orientación miARN
Visto:. Juzėnas S, V Saltenienė, Kupcinskas J, A Enlace , Kiudelis G, Jonaitis L, et al. (2015) Análisis de Liberalizado microARN y su objetivo genes en el cáncer gástrico. PLoS ONE 10 (7): e0132327. doi: 10.1371 /journal.pone.0132327
Editor: Zhang Lin, de la Universidad de Pennsylvania School of Medicine, Estados Unidos