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PLOS ONE: Asociación entre Prostinogen (KLK15) variantes genéticas y el cáncer de próstata de riesgo y la agresividad en Australia y un meta-análisis de los datos GWAS


Extracto

Antecedentes


calicreína 15 (KLK15) /Prostinogen
es un candidato plausible para la susceptibilidad al cáncer de próstata. Elevada
KLK15
expresión se ha informado en el cáncer de próstata y se ha descrito como un marcador pronóstico desfavorable para la enfermedad.

Objetivos

Se realizó un análisis exhaustivo de la asociación de variantes en el
KLK15
gen con riesgo de cáncer de próstata y la agresividad por tagSNPs genotipado, así como SNPs funcionales putativos identificados por el análisis extensos bioinformática.

Métodos y fuentes de datos

Doce de los 22 SNPs, seleccionados sobre la base del patrón de desequilibrio de ligamiento, se analizaron en una muestra australiana de 1.011 casos de cáncer de próstata histológicamente verificados y 1.405 controles emparejados étnicamente. La replicación se buscó a partir de dos estudios existentes genoma amplia asociación (GWAS):. Los marcadores genéticos de susceptibilidad del cáncer (CGEMS) proyecto y un estudio del Reino Unido GWAS

Resultados

Dos
KLK15
SNPs, rs2659053 y rs3745522, mostraron evidencia de asociación (p & lt; 0,05), pero no estaban presentes en las plataformas GWAS.
se encontró KLK15
rs2659056 SNP que se asocia con la agresividad del cáncer de próstata y mostró evidencia de asociación en una cohorte de 5.051 pacientes replicación del Reino Unido, Australia, y el conjunto de datos de muestras CGEMS estadounidenses. Se observó una asociación altamente significativa con la puntuación de Gleason cuando los datos se combinó a partir de estos tres estudios con un odds ratio (OR) de 0,85 (IC del 95% = 0,77 hasta 0,93; p = 2,7 × 10
-4). El SNP rs2659056 se predice para alterar la unión del factor de transcripción RORalfa, que tiene un papel en el control del crecimiento y la diferenciación celular y se ha sugerido para controlar el comportamiento metastásico de las células de cáncer de próstata.

Conclusiones

Nuestros hallazgos sugieren un papel de
KLK15
variación genética en la etiología del cáncer de próstata entre los hombres de ascendencia europea, aunque son necesarios para confirmar los tamaños del efecto más estudios en grandes conjuntos de la muestra.

Visto: J Batra, Lose M, T O'Mara, Marquart L, C Stephens, Alexander K, et al. (2011) Asociación entre
Prostinogen (KLK15)
variantes genéticas y el cáncer de próstata de riesgo y la agresividad en Australia y un meta-análisis de los datos GWAS. PLoS ONE 6 (11): e26527. doi: 10.1371 /journal.pone.0026527

Editor: Ronaldo Araujo, de la Universidad Federal de Sao Paulo, Brasil

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