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PLOS ONE: El efecto de los polimorfismos XPD /ERCC2 en gástrico riesgo de cáncer entre las diferentes etnias: una revisión sistemática y meta-Analysis


Extracto

Antecedentes

Potencial grupo xeroderma pigmentoso D (XPD) , también llamado de reparación por escisión del grupo transversal de cortesía dos (ERCC2), Lys751Gln y Asp312Asn polimorfismos han sido implicados en el riesgo de cáncer gástrico entre los diferentes grupos étnicos.

Métodos

el objetivo de explorar el efecto de XPD polimorfismos Lys751Gln y Asp312Asn en la susceptibilidad a cáncer gástrico entre los diferentes grupos étnicos a través de una revisión sistemática y meta-análisis. Cada artículo incluido inicialmente se anotó para la evaluación de la calidad. los datos deseables fueron extraídos y registrados en bases de datos. 13 estudios fueron en última instancia elegibles para el meta-análisis de Lys751Gln polimorfismo y 9 estudios para el metanálisis de Asp312Asn polimorfismo. Adoptamos el modelo genético más probable es apropiado (modelo recesivo) para ambos polimorfismos Lys751Gln y Asp312Asn. Las fuentes potenciales de heterogeneidad se buscó a través de análisis de subgrupos y de sensibilidad, y se estimaron los sesgos de publicación.

Resultados

resultados estadísticamente significativos se observaron en los asiáticos, aparentemente, pero no en los caucásicos, tanto para XPD Lys751Gln y XPD polimorfismos Asp312Asn. Un hallazgo estadísticamente significativo podría ser visto en el cáncer gástrico de tipo noncardia para XPD Lys751Gln polimorfismo. Un hallazgo estadísticamente significativo también podría ser visto en el subgrupo de alta calidad, subgrupo pequeño tamaño de la muestra y moderados, los artículos publicados después de 2007, o PCR-RFLP genotipado de subgrupos para XPD Asp312Asn polimorfismo.

Conclusiones

Nuestra meta-análisis indica que XPD Gln751Gln (CC) genotipo y Asn312Asn genotipo (AA) puede parecer ser más susceptibles al cáncer gástrico en poblaciones asiáticas, pero no en poblaciones caucásicas, lo que sugiere que los dos genotipos pueden ser importantes biomarcadores de susceptibilidad al cáncer gástrico para las poblaciones de Asia, la suposición de que necesita ser confirmado en estudios bien diseñados en las diferentes etnias. Gln751Gln (CC) genotipo también puede estar asociada con el tipo noncardia el riesgo de cáncer gástrico, que también debe ser confirmado entre los diferentes grupos étnicos en el futuro

Visto:. Xue H, Lu Y, Lin B, Chen J, Tang F, G Huang (2012) El efecto de la XPD /ERCC2 polimorfismos en el riesgo de cáncer gástrico en las diferentes etnias: una revisión sistemática y meta-análisis. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10.1371 /journal.pone.0043431

Editor: Rui Medeiros, IPO, Inst Puerto Oncología, Portugal

Recibido: 5 de Abril, 2012; Aceptado: July 20, 2012; De publicación: septiembre 13 de, 2012

Copyright: © Xue et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan

Financiación:. Este trabajo ha sido apoyado por la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China (subvenciones 30830038, 30970842, 81071180 y); Proyecto "973" (2012CB932604); Proyecto de descubrimiento de nuevo fármaco (2012ZX09506-001-005); Proyecto Llave de la Comisión de Ciencia y Tecnología de la municipalidad de Shanghai (subvenciones 10JC1410000); La disciplina y el Proyecto Líder Académico Shanghai (subvención S30203). Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito

Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia

Introducción

A pesar de que la incidencia de cáncer gástrico ha disminuido en todo el mundo, su mortalidad todavía ocupa el segundo lugar [1]. En China, el cáncer gástrico, incluso constituye una de las enfermedades más letales [2]. Como es ampliamente conocido, factores infecciosos, dietéticos, ambientales y genéticos están implicados en la carcinogénesis gástrica, pero aquellos expuestos a factores de riesgo que en última instancia desarrollar cáncer gástrico comprende una proporción menor [3], lo que sugiere que la susceptibilidad del huésped genética juega un papel importante en gástrico el riesgo de cáncer entre los diferentes grupos étnicos. Tales diferentes susceptibilidades podría explicarse, en parte, por los polimorfismos de nucleótido único (SNPs) de los genes susceptibles entre los diferentes grupos étnicos [4], [5]. Nuestros metaanálisis publicados anteriormente han proporcionado pruebas adicionales para tales diferencias étnicas susceptibles [5], [6].

Es un hecho ampliamente reconocido que el ADN debe permanecer estable para llevar a cabo sus funciones fisiológicas importantes, pero es persistente vulnerables a diversas daños endógenos y /o exógenos y por lo tanto sus mutaciones probables podrían acumular y pueden ocurrir debido a la carcinogénesis el ADN dañado. sistema de reparación del ADN, sin embargo, juega un papel vital en el mantenimiento de las funciones de las células normales y la integridad del genoma a través de la inversión de la DNA dañado [7]. Las mutaciones heredadas polimorfismos funcionales o acumulados de genes de reparación del ADN pueden influir en la capacidad de acogida para reparar el ADN dañado y por lo tanto modular el riesgo de cáncer [8]. SNPs de los genes de reparación del ADN común se han identificado [9] y ha demostrado estar relacionada con la carcinogénesis esporádica [10], [11].

reparación por escisión de nucleótidos (NER), una de las principales vías de reparación del ADN en los seres humanos , es capaz de eliminar las lesiones de base hélice que distorsionan producidos por la luz ultravioleta (UV) y una gran variedad de agentes químicos [12]. XPD se cree que participar en la anulación de ADN durante la transcripción NER y porque posee dependiente de ADN de cadena sencilla ATPasa y 5 '3-' actividades helicasa de ADN [13], [14]. XPD gen (ERCC2), ubicado en el cromosoma 19q13.3, consta de 23 exones y se cree que sus polimorfismos para generar alteraciones estructurales de la vía NER y la susceptibilidad del cáncer de influencia. Los más ampliamente investigado polimorfismos XPD en asociación con la susceptibilidad al cáncer comprenden un nonsynonymous A & gt; C sustitución en el exón 23 causando una lisina (Lys) a glutamina sustitución (Gln) en el codón 751 (Lys751Gln, rs1052559), un nonsynonymous G & gt; Una sustitución en el exón 10 que conduce a un ácido aspártico (Asp) a asparagina sustitución (Asn) en el codón 312 (Asp312Asn, rs1799793), y un sinónimo de C & gt; una sustitución en el exón 6, mientras que la conservación de la arginina (R) de residuos en el codón 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].

en 2005, Huang WY
et al.
publicó el primer estudio que participan en XPD Lys751Gln polimorfismo en relación con el riesgo de cáncer gástrico [16]. Desde entonces, los investigadores han informado de la asociación de XPD Lys751Gln, Asp312Asn, y /o Arg156Arg con la susceptibilidad al cáncer gástrico entre los diferentes grupos étnicos, pero con resultados mixtos o contradictorios [17] - [30]. Sólo hay un artículo publicado en relación con Arg156Arg polimorfismo en relación con el riesgo de cáncer gástrico [28]. Hasta la fecha, se han realizado tres metaanálisis publicados relevantes que se centran en los polimorfismos XPD [31] - [33]. Dos artículos se refieren principalmente a las susceptibilidades de cáncer en general en lugar de susceptibilidad al cáncer gástrico en profundidad [31], [32], lo que proporciona menos información sobre su asociación con el riesgo de cáncer gástrico. Más importante aún, estos tres meta-análisis [31] - [33] todos fallaron a adoptar el modelo genético más probable es apropiada, y así los auténticos valores de los resultados estadísticos podrían verse comprometidas

De acuerdo con ello, el objetivo de. nuestra meta-análisis fue explorar, utilizando el modelo genético más adecuado, el efecto de los polimorfismos XPD en el riesgo de cáncer gástrico entre los diferentes grupos étnicos y para identificar posibles fuentes de heterogeneidad entre los estudios elegibles.

Materiales y Métodos

Estrategia de búsqueda

Una búsqueda sistemática de la literatura se realizó los artículos referidos a los SNP XPD /ERCC2 asociados con el riesgo de cáncer gástrico. El MEDLINE, EMBASE, el chino Nacional del Conocimiento de Infraestructura (CNKI), Web of Science, y bases de datos BIOSIS se utiliza simultáneamente con la combinación de los términos "XPD", "ERCC2", "la reparación del ADN", "NER", "Lys751Gln", "Asp312Asn", o "Arg156Arg"; "gene"; "Polimorfismo", "variante", o "SNP"; y "cáncer gástrico", "carcinoma gástrico", o "cáncer de estómago" hasta diciembre de 2011. La búsqueda se llevó a cabo sin ningún tipo de restricciones de idioma. El alcance de la búsqueda bibliográfica computarizada fue ampliado en función de las listas de referencias de los artículos recuperados. Los artículos originales relevantes también se buscaron manualmente.

Selección de los estudios

Los estudios sobre la asociación de XPD /ERCC2 SNPs (Lys751Gln, Asp312Asn, y /o Arg156Arg) con el riesgo de cáncer gástrico se incluyeron si el se cumplieron las condiciones siguientes: (i) cualquier estudio que se describe la asociación de al menos uno de XPD /ERCC2 SNPs con cáncer gástrico; (Ii) cualquier estudio informó los números de ambos controles y casos de cáncer gástrico; (Iii) los resultados se expresaron como odds ratio (OR) con intervalos de confianza del 95% (IC); y (iv) los estudios fueron de casos y controles anidados o los casos y controles.

Calidad metodológica de la valoración

Para identificar los estudios de alta calidad, hemos adoptado principalmente criterios predefinidos para la Calidad similares propuestos inicialmente por Thakkinstian
et al
[34], adaptada por Camargo
et al
[35], y refinado por Xue
et al
[5] -... [7]. Los criterios (visto en la Tabla S1 en línea) cubren credibilidad de los controles, la representatividad de los casos, la consolidación de cáncer gástrico, el examen de genotipos, y la evaluación de la asociación. La calidad metodológica fue evaluada de forma independiente por dos investigadores (Lin B y Lu Y). Los desacuerdos se resolvieron mediante discusión. Las puntuaciones variaban desde el más bajo al más alto cero diez. Artículos con la puntuación más baja que 6,5 se consideraron los "de bajo o moderado de calidad", mientras que los no inferior a 6,5 ​​eran considerados como los de "alta calidad".

Extracción de datos

La siguientes datos de cada artículo se extrajeron: autores, año de publicación, país, el origen étnico de los participantes (clasificada como caucásicos, asiáticos, etc.), el diseño del estudio, fuente de controles, número de controles y de los casos, el método de determinación del genotipo, la distribución de la edad y el género, la clasificación de Lauren (intestinal y difuso, o mixto), la clasificación anatómica (cardias o no cardias cáncer), el hábito de fumar, beber hábito y
Helicobacter Pylori
estado de infección.

Los datos fueron extraídos y registrados en dos bases de datos de forma independiente por dos investigadores (Lin B y Lu y) que eran ciegos a los nombres de revistas, instituciones o donaciones de fondos. Cualquier discrepancia entre estos dos investigadores fue resuelto por el investigador (Xue H), que participó en la discusión con ellos y tomó una decisión definitiva.

Análisis estadístico

Se realizaron todos los análisis estadísticos utilizando STATA software estadístico (versión 10.1, STATA Corp, College Station, TX). Dos caras Sal & lt; 0,05 se consideró estadísticamente significativa. Hardy-Weinberg (HWE) en los controles se calculó de nuevo en nuestro meta-análisis. La bondad de chi-cuadrado de ajuste se utilizó para probar la desviación de HWE (significativo al nivel de 0,05).

La odds ratio (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC del 95%) se utilizaron para evaluar la fuerza de asociaciones entre XPD /ERCC2 SNP y el riesgo de cáncer gástrico. O
1, O
2 y O
3 se calcularon para los genotipos CC frente a AA, AC frente a AA, CC y CA frente a XPD polimorfismo Lys751Gln; AA frente GG, GA frente GG, GA y AA frente a XPD polimorfismo Asp312Asn; AA frente a CC, AC frente a CC y CA AA frente a XPD Arg156Arg polimorfismo, respectivamente. Se utilizaron las diferencias por pares para determinar el modelo genético más apropiado. Si O
1 = O
3 ≠ 1 y O
2 = 1, se sugiere un modelo recesivo. Si O
1 = O
2 ≠ 1 y O
3 = 1, un modelo dominante está implícito. Si O
2 = 1 /O
3 ≠ 1 y OR 1 = 1, se sugiere
overdominant un modelo completo. Si O
1 & gt; O
2 & gt; 1 y O
1 & gt; O
3 & gt; 1, o O
1 & lt; O
2 & lt; 1 y O
1 & lt; O
3 & lt; 1, un modelo codominante se indica [34]. Tome XPD polimorfismo Lys751Gln como un ejemplo para ilustrarlo. Si se indica un modelo dominante, la agrupación original se derrumbó y el nuevo grupo de transportistas C (CC plus CA) se comparó con el genotipo AA; Si se sugirió un modelo recesivo, CC se comparó con el grupo de AA más CA; si un modelo overdominant completa estaba implícito, el grupo de CC más AA se comparó con CA; o si se insinuó un modelo codominante, CC se comparó con CA y con AA, respectivamente.

El estadístico Q se utilizó para evaluar la heterogeneidad entre los estudios incluidos en el meta-análisis. I-cuadrado (
I

2) El valor, que representa la variación en O atribuible a la heterogeneidad se utilizó para cuantificar el grado de dicha heterogeneidad entre los estudios [36]. De acuerdo con los criterios publicados recientemente Venecia [37], "
I

2 & lt; 25% representa heterogeneidad,
I

2 = 25-50% representa heterogeneidad moderada,
I

2 = 50-75% representa una gran heterogeneidad, y
I

2 & gt; 75% representa heterogeneidad extrema ". varianza entre los estudios Tau-cuadrado (τ
2) también se utilizó para evaluar el valor de varianza entre los estudios. Un modelo de efectos fijos, utilizando el método de Mantel-Haenszel (M-H), se empleó para calcular los OR agrupados cuando existía homogeneidad sobre la base del valor de p prueba Q de no menos de 0.1.By el contrario, un modelo de efectos aleatorios, utilizando el método de DerSimonian y Laird (D + L), se utilizó si había heterogeneidad basada en el valor p de la prueba Q de menos de 0,1. Incluso para la homogeneidad entre-estudios, también se utilizó el método D + L. El meta-análisis de regresión y análisis de subgrupos se utilizó para explorar y controlar las posibles fuentes de heterogeneidad entre los estudios. La importancia de las RUP agrupados se probó mediante la prueba Z (P & lt; 0,05 se consideró significativo)
se realizó
El análisis de sensibilidad, en el cual se calcularon las estimaciones meta-análisis después de cada uno estudio que se omite en cada turno

por último, el sesgo de publicación se evaluó mediante la realización de gráficos de embudo cualitativamente, y estima por Begg y de las pruebas de Egger cuantitativamente.

Resultados

Literatura Búsqueda y Selección de los estudios

después de la búsqueda exhaustiva, se recuperaron un total de 140 artículos en Inglés y 7 en chino. En el metanálisis se incluyeron inicialmente en total 15 estudios [16] - [30], que cumplieron con los criterios de inclusión. Esos 15 estudios fueron preliminarmente apropiado para el meta-análisis de las asociaciones con cáncer gástrico con respecto XPD SNPs, entre los cuales 13 estudios de que se trate de polimorfismo XPD Lys751Gln [16] - [26], [28], [29], 9 estudios relacionados XPD Asp312Asn polimorfismo [17] - [21], [23], [27], [28], [30], y sólo 1 estudio en cuestión, XPD Arg156Arg polimorfismo [28]. 1 del artículo [23] fue indexada en los motores de búsqueda tanto en Inglés y Chino

Tradicionalmente hablando, cualquier estudio que se desvió de HWE debería haber sido eliminado.; sin embargo, Minelli C et al. ha señalado recientemente que los estudios que parecen desviarse de HWE deben investigarse más a fondo en lugar de sólo excluyen a menos que haya otros motivos para dudar de la calidad del estudio [38]. Hasta la fecha, aún no puede establecerse si los estudios se desvió de HWE deben ser incluidos o excluidos en la realización de meta-análisis. En este metanálisis, 3 estudios de que se trate XPD Lys751Gln polimorfismo [16], [25], [29] se desvió de HWE, y 3 estudios de que se trate polimorfismo XPD Asp312Asn [17], [27], [30] fueron también desviado de HWE; Sin embargo, teniendo en cuenta que el número de participantes en estos estudios eran grandes y dado que los análisis de sensibilidad se llevará a cabo, finalmente nos quedamos esos estudios en el metanálisis

Por lo tanto, 13 estudios [16] - [26]. , [28], [29] con un total de 6344 controles y 2750 casos de XPD Lys751Gln polimorfismo, y 9 estudios [17] - [21], [23], [27], [28], [30] con 3429 controles y 1715 casos de polimorfismo XPD Asp312Asn eran en última instancia elegibles para el meta-análisis de polimorfismos XPD. Las características correspondientes fueron vistos en la Tabla 1 y la Tabla 2. El diagrama de flujo de la selección búsqueda en la literatura y el estudio fue iluminada en la Figura 1.

En general metanálisis, Metarregresión Los análisis de subgrupos y análisis

Para XPD Lys751Gln polimorfismo, O
1 (valor p), O
2 (valor p), y O
3 (valor p) fueron de 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369) y 1,02 (p = 0,811), respectivamente, apenas insinuando un efecto determinado modelo de putativo alelo C susceptible. La heterogeneidad de ji cuadrado fue 29.83 (D. F. = 12), valor de p fue 0,003 y
I

2 fue de 59,8%. Tras el análisis de meta-regresión utilizando covariable única (etnia compuesta de los caucásicos, asiáticos, o de la población de Turquía), los valores de p de valor t coeficiente para los asiáticos, caucásicos, o población turca fueron 0,001, 0,139 y 0,585, respectivamente; lo que indica fuertemente que los asiáticos única covariable en su mayoría podría constituir la fuente de heterogeneidad entre los estudios. τ
2 para los asiáticos, caucásicos, o población turca única covariable fueron 0, 0,09178 y 0,1347, respectivamente. Para los asiáticos única covariable, τ
2 disminuyó de 0,1233 a 0, lo que indica asiáticos única covariable podría ser responsable de 100% de la fuente de heterogeneidad entre los estudios. Cuando se estratificó por el análisis de la etnicidad de subgrupos, O
1 (valor p), O
2 (valor p), y O 3 (valor p)
entre la población asiática fueron 2,63 (p = 0,002), 1.14 ( p = 0,653) y 1,51 (p = 0,034), respectivamente, lo que indica altamente un efecto modelo recesivo de putativo alelo C susceptibles (O
1 = O
3 ≠ 1 y O
2 = 1).

Para XPD Asp312Asn polimorfismo, O
1 (valor p), O
2 (valor p), y O
3 (valor p) fueron de 1,75 (p = 0,015), 1,15 (p = 0,549) y 1,47 (p = 0,003), respectivamente, altamente indica un efecto modelo recesivo de putativa susceptibles alelo a (O
1 = O
3 ≠ 1 y O
2 = 1) . La heterogeneidad de ji cuadrado fue 9,91 (D. F. = 8), el valor de p fue 0,272 y
I

2 fue del 19,2%, lo que indica heterogeneidad entre los estudios. Tras el análisis de meta-regresión utilizando covariable única (etnia compuesta de caucásicos o asiáticos), valor de p t valor del coeficiente de etnia única covariable fue 0,277, lo que indica que la etnicidad podría constituir una de las fuentes de poca heterogeneidad entre los estudios. τ
2 se redujo ,0354-,02075, lo que indica el origen étnico podría ser responsable de un 41,4% de la fuente de poca heterogeneidad entre los estudios. Del mismo modo, cuando se estratificó por el análisis de la etnicidad de subgrupos, O
1 (valor p), O
2 (valor p), y O
3 (valor p) entre la población asiática fueron 2,10 (p = 0,026), 1,22 (p = 0,574) y 1,80 (p = 0,008), respectivamente, lo que indica, además, un efecto modelo recesivo de putativa susceptibles alelo a (O
1 = O
3 ≠ 1 y O
2 = 1 ).

en conjunto, un modelo genético recesivo fue finalmente elegido para ambos polimorfismos XPD Lys751Gln y XPD Asp312Asn en nuestro meta-análisis.

en nuestro meta-análisis, los datos disponibles eran estratificada, a la luz de los participantes étnicos, en los caucásicos, asiáticos, y la población turca. En la Figura 2, resultados estadísticamente significativos se observaron en los asiáticos, pero no en los caucásicos o población turca (tanto XPD Lys751Gln y XPD polimorfismos Asp312Asn). Los OR agrupados (IC del 95%, valor p) fueron 2,41 (1,69 a 3,43; p = 0,000), 0,98 (0,82 a 1,17; p = 0,803) y 0,97 (0,33 a 2,82; p = 0,954) en los asiáticos, caucásicos, y la población turca (XPD Lys751Gln polimorfismo en la Parte a) o 1,77 (1,19 a 2,63; p = 0,005) y 1,31 (0,86 a 1,99; p = 0,211) en los caucásicos y los asiáticos (XPD Asp312Asn polimorfismo en la parte B), respectivamente. En cuanto a XPD Lys751Gln polimorfismo, los valores de p de heterogeneidad estadística Q en los caucásicos, asiáticos, y la población turca fueron 0,802, 0,701, y 0,045;
I

2 fueron 0,0%, 0,0% y 75,1%; y τ
2 fueron 0.0000, 0.0000, 0.4489 y, respectivamente, lo que demuestra sin heterogeneidad dentro de los caucásicos o los asiáticos, pero extrema heterogeneidad dentro de la población turca (se muestra en la Tabla 3). En cuanto a XPD Asp312Asn polimorfismo, los valores de p de heterogeneidad estadística Q en los caucásicos y los asiáticos fueron 0,180 y 0,470;
I

2 fueron 41,6% y 0,0%; andτ
2 fueron 0,0587 y 0,0000, respectivamente, lo que demuestra sin heterogeneidad dentro de los asiáticos, pero la heterogeneidad moderada dentro de los caucásicos (que se muestra en la Tabla 4).

Los estudios se introdujeron en la secuencialmente metanálisis por año de publicación. Los tamaños de los cuadrados indican el peso relativo de cada estudio. Las ponderaciones se derivan del análisis de efectos aleatorios. Bares, 95% intervalo de confianza (IC). A) El polimorfismo XPD Lys751Gln en asociación con el cáncer gástrico; B) XPD Asp312Asn polimorfismo en asociación con el cáncer gástrico.

Como se muestra en la Tabla 3 y la Tabla 4, los datos específicos para XPD Lys751Gln y XPD Asp312Asn polimorfismos fueron estratificados, respectivamente, en la base del tamaño de la muestra, en dos subgrupos: muestra grande (el número total de casos y controles no menos de 500) y pequeño de la muestra y moderados (el número total de los controles y los casos menos de 500) los subgrupos. No estadísticamente significativa hallazgo se observó en ambos subgrupos muestra de moderada a pequeña o grande y contraparte de la muestra para XPD Lys751Gln polimorfismo, dado que las RUP combinados (IC del 95%, valor p) fueron 0,96 (0,61 a 1,51; p = 0,858) para el primeros y 1,17 (0,84 a 1,64, p = 0,351) para el segundo, respectivamente; sin embargo, un hallazgo estadísticamente significativa se observó en el subgrupo pequeño de la muestra y moderados, pero no en gran contraparte muestra para Asp312Asn polimorfismo, dado que las RUP combinados (IC del 95%, valor p) fueron 1,74 (1,18 a 2,56; p = 0,005) para los primeros y 1,35 (0,82 a 2,21, p = 0,239) para el segundo, respectivamente.

los datos fueron también estratificado, de acuerdo con las puntuaciones de evaluación de la calidad, en alta calidad (puntuaciones de no menos de 6,5) y bajos y moderados (puntuaciones de calidad inferior a 6,5) subgrupos. En cuanto a XPD Lys751Gln polimorfismo, hallazgo estadísticamente significativo fue observado en ninguno de subgrupos de alta calidad o de baja y moderada contraparte calidad, dado que las RUP reunidas (IC del 95%, valor p) fueron 1,20 (0,91 a 1,60; p = 0,199) para el primero y 0,61 (0,34 a 1,11, p = 0,104) para el segundo. Cuando se realizó la etnia sub-estratificación para el subgrupo de alta calidad, un hallazgo estadísticamente significativo fue mucho parecer fue testigo de entre los asiáticos, pero sin resultado estadísticamente significativa se observó entre los caucásicos porque las RUP combinados (IC del 95%, valor p) fueron 2,54 (1,77 a 3,65, p = 0,000) para el primero y 0,98 (0,82 a 1,17, p = 0,803) para el segundo, respectivamente. En cuanto a Asp312Asn polimorfismo, un hallazgo estadísticamente significativo fue observado en el subgrupo de alta calidad, pero no en el de baja y moderada contraparte calidad, dado que las RUP combinados (IC del 95%, valor p) fueron 1,56 (1,05 a 2,33; p = 0,028) para el primero y 1,42 (0,85 a 2,40, p = 0,184) para el segundo. Del mismo modo, cuando se realizó la etnia sub-estratificación para el subgrupo de alta calidad, un hallazgo estadísticamente significativo fue mucho parecer fue testigo de entre los asiáticos, pero sin resultado estadísticamente significativa se observó entre los caucásicos porque las RUP combinados (IC del 95%, valor p) fueron 2,37 (1.29- 4,36, p = 0,005) para el primero y 1,31 (0,86 a 1,99; p = 0,211) para el segundo, respectivamente.

los datos fueron, además, estratificada, de acuerdo con el tiempo de publicación, en el subgrupo publicación anterior ( artículos publicados antes o en 2007) y la posterior publicación de subgrupos (artículos publicados después de 2007). En cuanto a XPD Lys751Gln polimorfismo, estadísticamente no se observaron hallazgos significativos sobre la base de que las RUP combinados (IC del 95%, valor p) fueron 0,89 (0,66 a 1,19; p = 0,428) en el primero y 1,23 (0,84 a 1,81; p = 0,285) en el segundo, respectivamente. En cuanto a Asp312Asn polimorfismo, se observó un hallazgo estadísticamente significativo en la tarde del subgrupo publicación, pero no en el subgrupo anterior publicación sobre la base de que las RUP combinados (IC del 95%, valor p) fueron 1.46 (01.02 a 02.09, p = 0,041) en los primeros y 1,61 (0,89 a 2,92, p = 0,115) en el segundo, respectivamente.

Cuando el cáncer gástrico se clasificó en no cardias (o distal) y subtipos cardias, se encontró un hallazgo estadísticamente significativa entre los no tipo -cardia pero no entre los de tipo cardias para XPD polimorfismo Lys751Gln con el argumento de que las RUP agrupados (IC del 95%, valor p) fueron 2,03 (1,16 a 3,54; p = 0,013) entre los de tipo no cardias y 0,88 (0,66 a 1,18, p = 0,403) entre el tipo cardias. En cuanto a Asp312Asn polimorfismo, se observó hallazgo estadísticamente significativa entre el tipo cardias con el argumento de que el OR combinado (IC del 95%, valor p) fue de 0,89 (0,56 a 1,43; p = 0,642), pero OR (IC del 95%, valor p ) con respecto al tipo no cardias no se pudo calcular debido a que sólo un estudio [21] se menciona claramente el número de genotipos de tipo no cardias.

En cuanto a la patología, cáncer gástrico podría ser clasificada en intestinal y difuso, o subtipos mezclado, pero sólo 1 estudio [19] claramente tratado y mencionó el número de genotipos de cáncer subtipo difuso; por tanto, la estratificación subtipo patológico no se podía hacer en nuestra meta-análisis.

Los factores de confusión tales como
Helicobacter pylori
infección o condición de fumador no pudieron analizarse en nuestra meta-análisis porque los datos necesarios de al menos dos estudios no pudieron ser accesible en nuestro meta-análisis.

Y cuando se consideraron las técnicas de genotipado, estadísticamente hallazgo significativo se observó en cada subgrupo técnica de genotipado de polimorfismos XPD Lys751Gln porque RUP combinado (95% IC, valor p) fueron de 0,94 (0,68 a 1,29; p = 0,701) y 1,67 (0,68 a 4,14; p = 0,265) en los RFLP y Tagman subgrupos, respectivamente; sin embargo, un hallazgo estadísticamente significativa se observó en el subgrupo RFLP genotipado pero no en el subgrupo de secuenciación directa Asp312Asn polimorfismo porque RUP reunidas (IC del 95%, valor p) fueron 1.90 (01.09 a 03.31, p = 0,023) y 1,24 (0,70 a 2,20, p = 0,450), respectivamente.

Análisis de sensibilidad

Los meta-análisis se llevaron a cabo varias veces cuando cada estudio en particular había sido eliminado. Los resultados indicaron que las estimaciones de efectos aleatorios antes y después de la eliminación de cada estudio fueron similares en general, lo que sugiere moderadamente alta estabilidad de los resultados del metanálisis. Para XPD Lys751Gln polimorfismo, como se muestra en la Figura 3 de la Parte A, el único estudio de mayor influencia sobre las estimaciones generales agrupadas parecía ser el estudio realizado por Long XD et al. [25], coincidentemente se desvió de HWE, el análisis de sensibilidad, sin embargo, se indica moderadamente alta estabilidad de los resultados a partir de los hechos que las RUP (IC del 95%, valor p) fueron 1,12 (0,85 a 1,48; p = 0,410) antes de su traslado de que el estudio y 0,98 (0,83 a 1,15, p = 0,781) después de la eliminación de ese estudio. A la vista del estudio [16] llevó a cabo por Huang WY et al. que se desvió de HWE, las RUP (IC del 95%, valor p) fueron 1,12 (0,85 a 1,48; p = 0,410) antes de la retirada de dicho estudio y de 1,17 (0,87 a 1,58; p = 0,309) tras la eliminación de ese estudio para todo el grupo étnico, lo que indica una alta estabilidad de los resultados. Del mismo modo, después de la eliminación del estudio [29] realizado por Engin AB et al., También se desvió de HWE, el OR (IC del 95%, valor p) se convirtió en 1,19 (0,91 a 1,57; p = 0,209) para todo el grupo étnico, que indica una alta estabilidad de los resultados. Si todos los tres estudios-HWE desviado [16], [25], [29] fueron retirados, el OR (IC del 95%, valor p) se convirtieron en 1,06 (0,88 a 1,28; p = 0,555) para todo el grupo étnico, lo que indica moderadamente alta estabilidad de los resultados (las figuras que ilustran fueron omitidos debido a la longitud del papel).

los resultados se calculan mediante la omisión de cada estudio (a la izquierda) a su vez. Bares, 95% intervalo de confianza. Se utilizaron en el metanálisis de efectos aleatorios estimaciones (forma exponencial). A) Análisis de la influencia de los coeficientes odds ratio sobre la asociación de polimorfismo XPD Lys751Gln con el riesgo de cáncer gástrico; B) Análisis de la influencia de los coeficientes odds ratio sobre la asociación de polimorfismo XPD Asp312Asn con el riesgo de cáncer gástrico.

Para Asp312Asn polimorfismo, como se muestra en la Figura 3 de la Parte B, el único estudio que más influyen en la estimaciones generales agrupadas parecía ser el estudio realizado por Chen Z et al. [28], el análisis de sensibilidad, sin embargo, indicaron moderadamente alta estabilidad de los resultados a partir de los hechos que las RUP (IC del 95%, valor p) fueron 1,48 (1,12 a 1,97; p = 0,007) antes de la retirada de ese estudio y 1,32 (1,04 a 1,70, p = 0,025) después de la eliminación de ese estudio. Si todos los tres estudios-HWE desviado [17], [27], [30] fueron retirados, el OR (IC del 95%, valor p) se convirtieron en 1,56 (1,05 a 2,33; p = 0,028) para todo el grupo étnico, indicando también moderadamente alta estabilidad de los resultados (las figuras que ilustran fueron omitidos debido a la longitud del papel).

Meta-análisis acumulativo

también se realizaron metanálisis acumulativos de XPD Lys751Gln asociación de polimorfismo entre los asiáticos y los blancos a través de la gama de tiempo de publicación y el número total de tamaño de la muestra. Como se muestra en la Figura 4 de la parte A, las inclinaciones hacia asociaciones significativas para XPD polimorfismo Lys751Gln se podían ver entre los asiáticos. En la Figura 4 de la parte B de las inclinaciones hacia las asociaciones nulos para XPD Lys751Gln polimorfismo podría señalar entre los caucásicos en orden cronológico. inclinaciones similares podrían ser observados por Asp312Asn polimorfismo entre las diferentes poblaciones etnicidad (cifras no se muestra)

A) entre los asiáticos.; B) entre los caucásicos.

sesgo de publicación Análisis

El sesgo de publicación se examinó de forma preliminar por los gráficos de embudo cualitativa y estima por Begg y de las pruebas de Egger cuantitativamente. Para XPD Lys751Gln polimorfismo, su distribución en embudo (Figura 5A) mostró que los puntos casi simétricamente distribuidos, predominantemente dentro de seudo límites de confianza del 95%. Los valores de p fueron 0,428 y 0,989 en el test de Begg y la prueba de Egger, respectivamente, insinuando sin sesgo de publicación. Para Asp312Asn polimorfismo, su distribución en embudo (Figura 5B) mostró que los puntos casi simétricamente distribuidos, predominantemente dentro de seudo límites de confianza del 95%. Los valores de p fueron 0,108 y 0,045 en el test de Begg y la prueba de Egger, respectivamente, insinuando no o un poco de sesgo de publicación

Nota:. Se utilizó parcela Embudo con seudo límites de confianza del 95%. A) Redireccionamiento parcela de sesgo de publicación para XPD polimorfismo Lys751Gln; B) Redireccionamiento parcela de sesgo de publicación para XPD Asp312Asn polimorfismo.

Discusión

En nuestro meta-análisis de resultados estadísticamente significativos se observaron en los asiáticos, aparentemente, pero no en los caucásicos, tanto para XPD y Lys751Gln polimorfismos XPD Asp312Asn. También se basa en los hallazgos de los metanálisis acumulativos, las inclinaciones hacia asociaciones significativas en los asiáticos, tanto para XPD Lys751Gln y polimorfismos XPD Asp312Asn podían ser vistos, obviamente, cuando ordenados por tiempo de publicación y el tamaño total de la muestra. XPD Gln751Gln (CC) y los genotipos Asn312Asn (AA) pueden parecen ser más susceptibles al cáncer gástrico en los asiáticos.

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