Extracto
En la India, el cáncer oral se ha alineado constantemente entre los tres principales causas de muerte por cáncer, y se ha convertido en una causa principal de las muertes por cáncer entre los hombres. La falta de opciones terapéuticas eficaces es uno de los principales retos en el manejo clínico de los pacientes con cáncer oral. Hemos interrogado gran piscina de muestras de estudios de expresión génica del cáncer orales para identificar posibles dianas terapéuticas que están involucradas en múltiples eventos sello cáncer. Las estrategias terapéuticas dirigidas a estos objetivos se pueden esperar para controlar eficazmente las células cancerosas. Los conjuntos de datos de diferentes estudios de expresión génica se integraron mediante la eliminación de los efectos de lote y se utilizó para los análisis posteriores, incluyendo el análisis de expresión diferencial. se realizó el análisis de redes de dependencias para identificar los genes que sufren marcados cambios topológicos en muestras de cáncer oral en comparación con las muestras de control. análisis de razonamiento causal se llevó a cabo para identificar las hipótesis significativas, lo que puede explicar los perfiles de expresión génica observados en las muestras de cáncer oral. La minería de texto enfoque basado se utilizó para detectar rasgos distintivos de cáncer asociados con los genes expresados de manera significativa en el cáncer oral. En total, se detectaron 2365 genes que se expresó diferencialmente los genes, que incluye algunos de los genes expresados altamente diferencialmente como las metaloproteinasas de matriz (MMP-1/3/10/13), quimiocinas (CXC motivo) ligandos (IL8, CXCL-10 /-11), PTHLH, SERPINE1, NELL2, S100A7A, MAL, CRNN, TGM3, CLCA4, queratinas (KRT-3/4/13/76/78), inhibidores de peptidasa SERPINB11 y serina (Spink-5/7). XIST, TCEAL2, ANR y FGFR2 son algunos de los genes importantes detectados por la dependencia y el análisis de la red causal. análisis de la literatura minera anotada 1014 genes, de los cuales 841 genes fueron anotados estadísticamente significativa. La integración de la producción de diversos análisis, resultó en la lista de posibles dianas terapéuticas para el cáncer oral, que incluye objetivos como ADM, TP53, EGFR, LYN, CTLA4, SKIL, CTGF y CD70
Visto:. Bundela S, Sharma A, Bisen PS (2014) posibles dianas terapéuticas para el cáncer oral: ADM, TP53, EGFR, Lyn, CTLA4, SKIL, CTGF, CD70. PLoS ONE 9 (7): e102610. doi: 10.1371 /journal.pone.0102610
Editor: Enrique Hernández-Lemus, Instituto Nacional de Medicina Genómica, México