Extracto
El objetivo fue identificar un ADN cáncer de próstata firma hipermetilación de microarrays (denotado como phyma) que diferencia el cáncer de próstata de la hiperplasia prostática benigna (HPB), alta de bajo grado y letal de los cánceres no letales . Se trata de un estudio retrospectivo no aleatorizado en 111 hombres asiáticos locales (87 cánceres de próstata y 24 BPH) tratados 1995-2009 en nuestra institución. epitelios de próstata fueron Archivo láser microdissected captura y el ADN genómico extraído y bisulfito convierte. Las muestras fueron perfilados usando Illumina GoldenGate La metilación de microarrays, con los datos en bruto procesados por GenomeStudio. Un modelo de clasificación se generó utilizando la máquina de vectores de soporte, que consiste en un 55-sonda de la metilación del ADN de la firma de 46 genes. El modelo fue validado de forma independiente en un conjunto de datos de prueba interna que produjo la sensibilidad de detección del cáncer y la especificidad de 95,3% y 100% respectivamente, con precisión global de 96,4%. En segundo lugar la validación en otra cohorte independiente occidental produjo sensibilidad del 89,8% y el 66,7% de especificidad, con precisión global de 88,7%. Una puntuación phyma fue desarrollado para cada muestra basándose en el estado de metilación en la firma phyma. Aumento de la puntuación phyma se asoció significativamente con un mayor grado de Gleason y el grado de Gleason primario. Los hombres con puntuaciones de phyma más altos tienen una peor supervivencia en univariado (p = 0,0038, HR = 3,89) y multivariado cuando se controla por (i) el estadio clínico (p = 0,055, HR = 2,57), y (ii) el estadio clínico y puntuación de Gleason ( p = 0,043, HR = 2,61). Además, realizó la secuenciación genómica de bisulfito en 2 genes relativamente desconocidos para demostrar la robustez de los resultados del ensayo. Phyma es, pues, una firma con una alta sensibilidad y especificidad para discriminar los tumores de la HPB, y tiene un papel potencial en la detección temprana y en la predicción de la supervivencia
Visto:. Goh LK, Liem N, Vijayaraghavan A, Chen G, Lim PL, Tay KJ, et al. (2014) Utilidad diagnóstica y pronóstica de una firma ADN hypermethylated génica en el cáncer de próstata. PLoS ONE 9 (3): e91666. doi: 10.1371 /journal.pone.0091666
Editor: Jörg D. Hoheisel, Deutsches Krebsforschungszentrum, Alemania