calcineurina (CN) detecta concentraciones de Ca2 + y transduce la información en las respuestas celulares. La señalización a través CN juega un papel crítico en los procesos que van desde la supervivencia de respuesta al estrés en la levadura de desarrollo de los mamíferos. En este caso, nos informan de que? -syn, De la levadura a las neuronas, conduce a niveles muy elevados sostenidos de citoplasmática de Ca2 +, activando de este modo una cascada de CaM-CN que involucra a sustratos que resultan en toxicidad.
En primer lugar, se demuestra que el aumento de los niveles de? -syn aumento de expresión citosólica de Ca2 + concentraciones. Las mutaciones o la expresión aberrante de? Sinucleína (? -syn), Una proteína importante involucrado en la patogénesis de la PD, pueden inducir sobrecarga de Ca2 + y la muerte celular. dopaminérgicas del mesencéfalo (DA) neuronas que sobreexpresan proteínas Ca2 + -vinculante, que amortiguan el Ca2 + intracelular, se ahorran característico de la degeneración.
A continuación, se muestra que la actividad de la calcineurina parcial es necesario para proteger contra? toxicidad -syn ex vivo e en vivo. función CN puede ser eliminado mediante la supresión de la subunidad reguladora cnb1 solo o por la deleción combinada de las subunidades catalíticas CNA1 y CNA2.
Se examinó la activación de NFAT en el tejido postmortem fijo de los seres humanos con diagnóstico de PD o con una sinucleinopatía más agresivo , demencia con cuerpos de Lewy (DCL). La mayor sensibilidad de las neuronas DA SNc a Ca2 + estrés agravaría los defectos en el tráfico de vesículas.
Estos resultados tienen implicaciones terapéuticas inmediatas para sinucleinopatías.
Un importante sistema modelo para la diferenciación es la hematopoyesis, en que una sola célula madre hematopoyética da lugar a un gran número de tipos de células a través de una serie de células progenitoras intermedias caracterizados. Sus limitaciones técnicas ralentizan perfiles de intermedios de diferenciación homogéneos. Aquí, hemos desarrollado un método de indexación-chip primera de alta sensibilidad para perfilar la dinámica de cuatro modificaciones de la cromatina a través de 16 etapas de diferenciación hematopoyética.
El límite inferior para el análisis de la cromatina en todo el genoma es de aproximadamente 50.000 células, para una celda casi tiene 4 pg de ADN. Nombramos el nuevo enfoque de la iChip, lo que implica una etapa de códigos de barras de la cromatina inicial antes de chip con el anticuerpo deseado. Se realizó el chip de la cromatina con código de barras con un anticuerpo de mono y trimethylated histona H3 lisina 4 (H3K4me1 y H3K4me3). En total, se han analizado 48,415 potenciadores (alta H3K4me1 /2 y la baja H3K4Me3) y 17.923 promotores (highH3K4me3). La agrupación de todos los picos de 48,415 H3K4me1 durante la hematopoyesis reveló 9 grupos principales, de acuerdo con la biología subyacente del sistema.
Para resumen, iChip permite la ejecución de chip reproducible y sensible en sólo unos pocos cientos de células. Combinando nuestro catálogo potenciador con perfiles de expresión génica, elucidamos la red factor de transcripción que controla la dinámica de la cromatina y la especificación de linaje en la hematopoyesis.