Extracto
El cáncer colorrectal es uno de los tipos más comunes de cáncer y no hay requisito para la identificación de biomarcadores de pronóstico. En esta proteína estudio se han establecido los perfiles de expresión para el cáncer colorrectal y mucosa colónica normal por la proteómica utilizando una combinación de electroforesis en gel bidimensional con las secciones frescas congeladas de cáncer emparejado Dukes B colorrectal y mucosa colorrectal normal (n = 28), el análisis de imágenes de gel y cromatografía líquida de alta resolución-espectrometría de masas en tándem. El análisis de agrupamiento jerárquico y análisis de componentes principales mostraron que los perfiles de expresión de proteínas de cáncer colorrectal y de la mucosa colónica normal agrupados en patrones distintos de expresión de la proteína. Cuarenta y cinco proteínas se identificaron como muestra de al menos 1,5 veces mayor expresión en el cáncer colorrectal y la identidad de estas proteínas se confirmó por espectrometría de masas en tandem con cromatografía líquida. Quince proteínas que mostraron una mayor expresión fueron validados por inmunohistoquímica utilizando un microarray de tejido de cáncer colorrectal bien caracterizado que contiene 515 cáncer colorrectal primario, metástasis en los ganglios linfáticos 224 y 50 muestras normales mucosa colónica. Las proteínas que mostraban el mayor grado de sobreexpresión en cáncer colorrectal primario en comparación con mucosa colónica normal fueron proteína de choque térmico 60 (p & lt; 0,001), S100A9 (p & lt; 0,001) y la proteína tumor translationally controlada (p & lt; 0,001). Análisis de proteínas identificado individualmente 14-3-3β como un biomarcador pronóstico (χ
2 = 6,218, p = 0,013, HR = 0,639; IC del 95%: 0,448-0,913). análisis de agrupamiento jerárquico identificado distintos fenotipos asociados con la supervivencia y una firma de dos proteínas que consiste en 14-3-3β y aldehído deshidrogenasa 1 se identificó como muestra de importancia pronóstica (χ
2 = 7.306, p = 0,007, HR = 0,504, 95 IC 0,303-0,838%) y que se mantuvo independiente de pronóstico (IC p = 0,01, HR = 0,416, 95% 0,208-0,829) en un modelo multivariado
Visto:. O'Dwyer D, Ralton LD, O ' Shea a, Murray GI (2011) Los Proteómica de cáncer colorrectal: identificación de una firma de proteínas relacionadas con el pronóstico. PLoS ONE 6 (11): e27718. doi: 10.1371 /journal.pone.0027718
Editor: Christina Lynn Addison, Ottawa Instituto de Investigación del Hospital, Canada