Extracto
Antecedentes
apurinic /endonucleasa apyrimidinic 1 (
APE1
) tiene un papel central en la reparación de los sitios apurínicos apyrimidic tanto a través de su endonucleasa y sus actividades de la fosfodiesterasa. Un común
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polimorfismo, T1349G (rs3136820), se había demostrado que se asocia con el riesgo de cáncer.
Objetivo
La hipótesis de que el
APE1
T1349G polimorfismo también se asocia con el riesgo de cáncer gástrico.
Métodos
En un estudio de casos y controles de base hospitalaria de 338 casos de pacientes con cáncer gástrico recién diagnosticado y 362 controles sin cáncer frecuencia emparejados por edad y sexo, genotipo del polimorfismo T1349G y se evaluó su asociación con el riesgo de cáncer gástrico.
Resultados
en comparación con el
APE1
genotipo TT, individuos con la variante TG genotipos /GG tenían un riesgo significativamente mayor de cáncer (odds ratio = 1,69, 95% intervalo de confianza = 1,19-2,40) gástrico, que fue más pronunciada entre los subgrupos de edad ≤ 60 años, de sexo masculino, fumadores cada vez, y para siempre bebedores. Los análisis posteriores revelaron que los genotipos variantes se asociaron con un mayor riesgo de tipo difuso, baja profundidad de infiltración tumoral (T1 y T2), y el cáncer gástrico metástasis ganglionares.
Conclusiones
La
APE1
polimorfismo T1349G puede ser un marcador para el desarrollo de cáncer gástrico en la población china. Se requieren estudios más amplios para validar estos resultados en diversas poblaciones
Visto:. Gu D, Wang M, S, Wang, Zhang Z, Chen J (2011) La reparación de ADN del gen
APE1
T1349G polimorfismo y el riesgo de cáncer gástrico en una población china. PLoS ONE 6 (12): e28971. doi: 10.1371 /journal.pone.0028971
Editor: Paolo Peterlongo, IFOM, Fondazione Istituto di Oncologia FIRC Molecolare, Italia |
Recibido: 19 Octubre, 2011; Aceptado: 18 Noviembre 2011; Publicado: 19 de diciembre 2011
Derechos de Autor © 2011 Gu et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Este estudio fue apoyado en parte por la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China (81071641), la Fundación de Ciencias Naturales de la provincia de Jiangsu (BK2010120), y el Proyecto de Programa de Ciencia y Nanjing (201001099). Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el cáncer gástrico es el cuarto cáncer más común y la segunda causa principal de muerte relacionada con el cáncer en todo el mundo, aproximadamente 700.000 personas mueren de esta enfermedad maligna cada año, y se espera que alrededor de 1,1 millones de nuevos casos en 2010 [1]. En China, se prevé que la situará como el tercer cáncer más común en 2005, con 0,3 millones de muertes y 0,4 millones de nuevos casos de cáncer gástrico [2]. Aunque es bien sabido que los factores ambientales, los hábitos dietéticos y
Helicobacter pylori
infecciones están asociadas con el riesgo de cáncer gástrico, factores genéticos del huésped puede ser uno de los agentes más importantes en la carcinogénesis gástrica. Presentación de cáncer gástrico en pacientes jóvenes se asocia con frecuencia con la agrupación familiar [3].
daño del ADN inducido por carcinógenos exógenos o por procesos metabólicos endógenos se puede convertir en mutaciones genéticas que conduce a la inestabilidad genómica y la transformación maligna [4] . Las variaciones genéticas en los genes de reparación del ADN pueden modular la capacidad de reparación del ADN y, por consiguiente, alterar el riesgo de cáncer. Alrededor de 150 genes de reparación del ADN humano se han identificado a los datos [5]. Ellos están cooperando en distintas vías que se especializan en la reparación de los diferentes tipos de daño en el ADN [6], [7]. Entre estas vías, la vía de reparación por escisión de base (BER), que posiblemente maneja el mayor número de lesiones citotóxicas y de base mutagénica, se ha asociado con el riesgo de cáncer [8].
La endonucleasa apurinic /apyrimidinic humana ( APE),
APE1 gratis (también conocido como
APE
,
APEX
, y
REF-1 |), participa en la vía de REC [9 ]. El
APE1
gen se localiza en el cromosoma 14q11.2-q12, y se compone de cinco exones que abarcan 2,21 kb. Por hidrólisis de 3 'de bloqueo de fragmentos de ADN oxidado,
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produce normales termini de nucleótidos 3'-hidroxilo que son necesarias para la síntesis de reparación del ADN y la ligadura en una o roturas de la doble hebra de [10], [11] . Un total de 18 polimorfismos en
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han sido reportados [12], pero el polimorfismo más ampliamente estudiado es la transversión T a G (T1349G, también conocido como Asp148Glu, rs3136820).
Recientemente , hemos llevado a cabo un meta-análisis de todos los estudios de casos y controles elegibles para estimar el
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polimorfismo T1349G y el riesgo de cáncer, incluyendo el cáncer de pulmón, cáncer de vejiga, cáncer colorrectal, cáncer de mama, cáncer de páncreas, cabeza y el cáncer de cuello, leucemia, cáncer de esófago, cáncer del tracto biliar, cáncer de tiroides, y cáncer de próstata [13]. Se encontró que los
Ape1
variante genotipos T1349G se asociaron con un aumento moderado del riesgo de todos los tipos de cáncer (OR = 1,08, IC del 95% = 1,00-1,18 en un modelo dominante), lo que sugiere que este polimorfismo es mínima factor de riesgo -penetrance para el desarrollo del cáncer [13]. Más recientemente, algunos estudios informaron el
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polimorfismo T1349G se asoció con el riesgo de cáncer gástrico y el pronóstico [14], [15], [16], [17]. Sin embargo, estos resultados epidemiológicos permanecen en conflicto y no conclusiva.
En el presente estudio, para investigar el efecto de la
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polimorfismo T1349G sobre el riesgo de cáncer gástrico, genotipo del polimorfismo y evaluamos la asociación entre el
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polimorfismo T1349G y el riesgo de cáncer gástrico en nuestro estudio de casos y controles en curso, basado en el hospital en una población china.
Materiales y Métodos
Declaración de ética
el comité de ética de la Universidad de Medicina de Nanjing ha aprobado el protocolo de investigación. Durante las entrevistas epidemiológicas, se le dio el consentimiento informado por escrito para todos los sujetos. Por otra parte, el personal capacitado de investigación administró un cuestionario estándar para obtener información sobre las características demográficas.
Los sujetos del estudio
Los métodos detallados de los sujetos del estudio de reclutamiento para este estudio han sido descritas previamente [18]. Brevemente, 338 recién diagnosticado, histopatológico confirmó los pacientes con cáncer gástrico y 362 sujetos de control sin cáncer fueron reclutados de las ciudades de Zhenjiang y Yixin, dos regiones de alta incidencia y mortalidad del cáncer gástrico en la provincia de Jiangsu de China, entre marzo de 2006 y julio de 2008 . Los criterios de exclusión incluyeron previo contra el cáncer, metástasis de cáncer de otros orígenes o desconocidas, y la radioterapia o la quimioterapia previa. Los controles fueron emparejados por la frecuencia de los casos por edad (± 5 años) y sexo. Los sujetos control sin cáncer fueron reclutados de los que estaban buscando la atención de salud, que viven en las mismas áreas residenciales. Antes de la contratación, se obtuvo el consentimiento de cada uno de los sujetos elegibles. Para cada individuo, información demográfica, así como datos sobre el estado de fumar y el alcohol utilización se obtuvo a través de entrevistas cara a cara. Los individuos que fumaban vez al día durante más de 1 año se definieron como fumadores cada vez. Alguna vez los fumadores que habían dejado de fumar durante más de 1 año se definieron como los ex fumadores, y los otros fumadores que los fumadores actuales. Las personas que consumían una o más bebidas alcohólicas por semana durante al menos 1 año fueron considerados bebedores nunca, y el resto se definieron como nunca bebieron. Después de la entrevista, muestra de sangre sobre 5 ml venosa se recogió de cada participante.
Genotipado
ADN genómico fue extraído a partir de linfocitos de sangre periférica por digestión con proteinasa K, seguido por extracción con fenol-cloroformo y precipitación con etanol [19]. La
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polimorfismo T1349G se determinó utilizando el método (PCR-RFLP), que ha sido descrito anteriormente en cadena de polimerasa reacción de restricción de longitud de fragmentos de polimorfismo [20], [21]. Se diseñó el cebador de 5 'TAATTCTGTTTCATTTCTATAGGCTA-3' (hacia delante) y 5'-TGCATTAGGTACATATGCTGTT-3 '(inverso) para amplificar el fragmento diana de la
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. Las muestras se sometieron a desnaturalización a 95 ° C durante 5 min, seguido de 30 ciclos de calentamiento a 95 ° C durante 30 s, hibridación a 55 ° C durante 40 s, a continuación, extensión a 72 ° C durante 45 s, y una incubación final a 72 ° C durante 10 min. Los productos de PCR de 108 pb fueron digeridos por la
FspB
enzima de restricción I, para identificar genotipos del polimorfismo T1349G. Después de la digestión con enzimas, la variante G alelo produce 2 fragmentos de 82 pb y 20 pb, y la de tipo salvaje alelo T resultó en un único 108-bp fragmento.
Los análisis de genotipo fueron realizadas por dos personas independientemente de una manera ciega. Alrededor del 10% de las muestras fueron seleccionados al azar para su confirmación, y los resultados fueron completamente concordantes.
El análisis estadístico
Las diferencias entre los casos y controles en las variables demográficas seleccionadas, el hábito de fumar, consumo de alcohol, y cada alelo y genotipo de los polimorfismos de
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gen se evaluaron mediante la prueba de Chi-cuadrado. También se utilizó la prueba de chi-cuadrado para evaluar la diferencia entre el
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polimorfismo y características clínico-patológicas. Las asociaciones entre el
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genotipos y el riesgo de cáncer gástrico se estimaron mediante el cálculo de la odds ratio (OR) y sus intervalos de confianza del 95% (IC) a partir de los análisis de regresión logística univariante y multivariante incondicional. Estos análisis se repitieron al estratificar por sexo (masculino, femenino), tabaquismo (nunca, nunca) y la condición de potable (no, sí). Para la estratificación por edad, se utilizó el límite de edad a los 60 años en este estudio, ya que era la edad media de los pacientes y los controles reclutados. Por otra parte, los riesgos-genotípica específica también se estimaron por separado para el sitio cardias /noncardia tumoral, histotype intestinal /difusa, profundidad T1 /T2 /T3 /T4 de la infiltración tumoral y la metástasis positivo negativo /de los ganglios linfáticos. Hardy-Weinberg del genotipo distribuciones de los diversos controles fue sometido a una prueba de chi-cuadrado de bondad de ajuste. Dos lados pruebas de significación estadística se llevaron a cabo utilizando el software SAS (versión 8.2; SAS Institute, Inc., Cary, NC).
Resultados
Distribución de características seleccionadas entre el cáncer gástrico los casos y los controles se resumen en la Tabla 1. de acuerdo con los resultados de genotipado y datos de los cuestionarios, se incluyeron 338 casos de cáncer gástrico y 362 controles sin cáncer que tenían todos los datos disponibles en este análisis. La edad media al diagnóstico de los casos de cáncer gástrico fue de 61,7 años (desviación estándar (DE) ± 12,3) y la media de edad en la determinación de los controles fue de 62,4 años ((SD) ± 10,5). No hubo diferencias estadísticamente significativas entre los casos y controles en la distribución de la edad y el sexo. Sin embargo, una mayor incidencia de fumar y beber están asociados con el cáncer gástrico (
P Hotel & lt; 0,05). Además, los pacientes con cáncer del cardias gástrico y no cardia fueron 143 (42,3%) y 195 (57,5%), respectivamente. Los tipos histológicos fueron 192 (56,8%) para intestinal y 146 (43,2%) para el cáncer gástrico difuso. Para la profundidad de infiltración tumoral, T1, T2, T3, y T4 fueron 104 (30,8%), 64 (18,9%), 126 (37,3%), y 44 (13,0%), respectivamente. Y los ganglios linfáticos positivos se identificaron en 174 (51,5%) casos.
Las frecuencias alélicas y genotípicas de la
APE1
polimorfismo T1349G entre los casos y los controles y las asociaciones con el riesgo de cáncer gástrico se muestran en la Tabla 2. las frecuencias de la TT, TG, y los genotipos GG fueron 20,4%, 54,7% y 24,9% en el grupo de cáncer, frente a 30,4%, 50,5% y 19,1% en individuos sanos normales, respectivamente . La frecuencia de alelo G era 52,2% entre los casos, lo que fue significativamente mayor que en los controles 44,3% (
P
= 0,003). Un análisis posterior reveló una asociación significativa de heterocigotos (TG) y homocigotos (GG) de genotipo variante
APE1
T1349G con el riesgo de cáncer gástrico (OR = 1,61, IC del 95% = 1,12 a 2,32 para los TG frente a TT y OR = 1,92, IC del 95% = 1,23 a 2,99 para GG contra TT, respectivamente). Además, hemos encontrado que los individuos con los genotipos variantes TG /GG tenían un riesgo significativamente mayor de cáncer gástrico que aquellos con el genotipo TT (OR = 1,69 IC 95% = 1,19-2,40). más análisis estratificados mostraron que el aumento del riesgo fue más evidente en los subgrupos de años aged≤60 (OR = 2,00, IC del 95% = 1,11-3,61), masculino (OR = 1,65; IC del 95% = 1,07-2,55), fumadores cada vez ( OR = 2,00, IC del 95% = 1.14 a 3.5), y cada vez bebedores (OR = 2,18, IC del 95% = 1.18 a 4.3) (Tabla 3). Sin embargo, debido al tamaño de la muestra de estudio limitado, todos los resultados de los análisis estratificados eran preliminares.
Asociación entre la
APE1
polimorfismo T1349G y las características clínico-patológicas de riesgo de cáncer gástrico estratificado en el sitio del tumor, el tipo histológico, la profundidad de la infiltración tumoral y la metástasis de los ganglios linfáticos se muestran en la Tabla 4. el análisis estadístico reveló una asociación significativa de TG genotipos /GG con el riesgo de tumores de cardias y el tumor no cardias (OR = 1,61, 95 CI = 1,01-2,56%, y OR = 1,79, IC del 95% = 1,17 a 2,73, respectivamente). Estadísticamente, se detectó una tendencia hacia un mayor riesgo de cáncer gástrico de tipo difuso para los genotipos TG /GG (OR = 2,09, IC del 95% = 1.29-3.42), pero no hubo diferencia significativa entre los cánceres gástricos de tipo intestinal y los controles normales (OR = 1,46, IC del 95% = 0,97-2,20). Un análisis más detallado de la estratificación profundidad de la infiltración tumoral mostró que el aumento del riesgo era más pronunciado entre T1 (OR = 2,73, IC del 95% = 1,50-4,99) y T2 (OR = 2,17, IC del 95% = 1,08 a 4,33), pero no hubo no hay diferencias significativas entre las distribuciones en subgrupos de T3 y T4 (OR = 1,28, IC del 95% = 0,80 a 2,04 y OR = 1,26, IC del 95% = 0,61 a 2,60, respectivamente). Además, hubo un aumento en el riesgo significativo de cáncer gástrico con ganglios positivos (OR = 1,80, IC del 95% = 1,16-2,80), aunque no en el cáncer gástrico con ganglios negativos (OR = 1,62, IC del 95% = 0,99-2,51) con los genotipos TG /GG en comparación con el genotipo TT.
Discusión
En este estudio de casos y controles de base hospitalaria, se investigó la asociación de
APE1
polimorfismo T1349G y el riesgo de cáncer gástrico en la población china. Se encontró que el polimorfismo T1349G contribuyó al riesgo de cáncer gástrico, el cual fue más pronunciado entre los subgrupos de años aged≤60, varón, nunca fumadores y bebedores nunca. Además, el polimorfismo T1349G se asoció con un mayor riesgo de difusa de tipo, baja profundidad de infiltración tumoral (T1 y T2), y el cáncer gástrico de ganglios linfáticos metástasis.
APE1 es una enzima esencial en la vía BER, que es el mecanismo primario para la reparación del daño del ADN causado por la oxidación y alquilación [7]. El polimorfismo T1349G es el polimorfismo más común que dan como resultado la sustitución de un solo aminoácido se ha identificado en la población general [12]. No se ha determinado si la variante de alelo G tiene un impacto en las actividades de unión al ADN [22] endonucleasa y. Sin embargo, el genotipo GG se ha asociado con retrasos G2 del ciclo celular prolongó significativamente en comparación con los genotipos TT y TG, lo que sugiere que esta sustitución de aminoácidos puede contribuir a la hipersensibilidad a la radiación [23] ionizante. Nuestro estudio encontró que la variante alelo G se asoció con un aumento significativo del riesgo de cáncer gástrico, lo cual es consistente con nuestros resultados del metanálisis publicados anteriormente [13]. En estudios anteriores, Canbay et al. [15] encontraron diferencias significativas en las frecuencias de alelo G de
APE1
polimorfismo T1349G entre los pacientes con cáncer gástrico y sujetos control en una población turca. Sin embargo, Palli et al. [16] no observaron una asociación significativa de este polimorfismo con el cáncer gástrico en su estudio. La razón de estos diferentes hallazgos sigue sin estar clara, lo que podría debido al pequeño tamaño de la muestra o étnicamente diversa.
En la adición, se encontró que el polimorfismo T1349G se asoció con un mayor riesgo de cáncer gástrico entre los subgrupos de pacientes más jóvenes ( age≤60 años), pero no sujetos de edad avanzada. Sistema inmunológico débil y la exposición acumulada abrumadora a los carcinógenos ambientales en las personas mayores pueden dar cuenta de la diferencia de edad se observó [24]. Los individuos mayores están en un mayor riesgo de cáncer gástrico, que es más probable debido al efecto de envejecimiento en lugar de efectos genéticos directos. Por lo tanto, la variación en el gen
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puede ser más influyente en el cáncer gástrico de aparición temprana, aunque este resultado necesita más confirmaciones. El humo del tabaco contiene cientos de sustancias químicas, que fue establecido de manera inequívoca como el principal factor causante de cáncer gástrico [25]. Nuestros resultados indican que el riesgo asociado con el polimorfismo T1349G fue más evidente en los fumadores. Esto puede deberse a que el humo del cigarrillo genera la producción de especies reactivas de oxígeno e induce aductos de ADN [26]. Los estudios han informado de que la ingesta de aumento de alcohol puede aumentar el riesgo de cáncer, incluyendo el cáncer gástrico [27]. Constantemente, nuestros resultados también revelaron que los sujetos que nunca han consumido alcohol con el polimorfismo T1349G tienen un mayor riesgo de cáncer gástrico. Sin embargo, nuestro pequeño tamaño de la muestra podría no tener una potencia suficiente para detectar la interacción significativa genes y medio ambiente; por lo tanto, se necesitan estudios más grandes con datos más detallados de exposición ambiental para verificar estos hallazgos.
intestinales y difusos tipos tienen diferente epidemiología y patogenia. El tipo intestinal cáncer gástrico es la variación internacional y predomina en las zonas geográficas de alto riesgo, especialmente en Japón, Corea y China, mientras que el cáncer gástrico de tipo difuso tiene distribuciones geográficas uniformes [28], [29]. Se han propuesto factores ambientales juegan un papel importante en la etiología del cáncer gástrico de tipo intestinal, y los factores genéticos de susceptibilidad pueden contribuido más al desarrollo de cáncer gástrico de tipo difuso. Curiosamente, se encontró que el efecto del polimorfismo T1349G se asocia con el cáncer gástrico de tipo difuso pero el cáncer gástrico de tipo intestinal no. Además, se encontró que el polimorfismo T1349G se asoció con un mayor riesgo de baja profundidad de infiltración tumoral (T1 y T2), y el cáncer gástrico de ganglios linfáticos de metástasis, lo que puede servir como un biomarcador de la metástasis del cáncer gástrico. Sin embargo, debido a que el tamaño del efecto detectable en nuestro estudio fue relativamente pequeño (n = 11 para el genotipo TT en los subgrupos T1 y T2), la utilidad clínica de nuestros resultados deben interpretarse con precaución. Por otra parte, el mecanismo biológico en relación con
APE1
variante, el
APE1
la expresión génica, y el desarrollo de cáncer gástrico y metástasis aún no se han explorado.
En conclusión, nuestro estudio sugiere que la
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polimorfismo T1349G puede estar asociada con el riesgo de desarrollo de cáncer gástrico en la población china. Grandes estudios prospectivos basados en la población con poblaciones étnicamente diversas están garantizados para verificar estos hallazgos.