Extracto
El factor de transcripción elemento represor silenciamiento (REST) es un regulador transcripcional y epigenéticos que funciona como un supresor de tumor o un oncogen dependiendo del contexto celular, y una variante de empalme resto4 truncada se ha relacionado con coordenadas varios tipos de cáncer. Se realizó un análisis exhaustivo de splicing alternativo (AS) de
RESTO fotos: por amplificación rápida de extremos de ADNc y la amplificación por PCR de ADNc de diversos tejidos y líneas celulares con primers específicos. Se identificaron 8 nuevos exones alternativos incluyendo un suplente último exón que duplica la
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límite gen, junto con numerosos sitios 5 '/3' de empalme y termina en los exones constitutivos. Con la combinación de diferentes patrones de empalme (por ejemplo, la omisión de exón y el uso alternativo de los primeros y últimos exones) que son predictivos de la actividad REST alterada, al menos 45 empalmados alternativamente variantes de codificación y mRNA no codificantes se expresaron en una especie y célula forma de tipo /específico de tejido con las diferencias individuales. Al examinar el repertorio de
resto de pre-mRNA de empalme en 27 pacientes con cáncer de pulmón riñón, hígado y, se encontró que todos los pacientes, sin excepción, mostraron expresión diferencial de varios
variantes
resto de empalme entre emparejado tumor y los tejidos normales adyacentes, con una llamativa del tipo de célula /tejido y las diferencias individuales. Por otra parte, que reveló que la omisión de exón 3, que no causa ningún cambio de marco, pero la pérdida de un dominio esencial para la translocación nuclear, se vio afectada por la pioglitazona, un activador muy selectivo de la proliferación de peroxisoma receptor gamma activado (PPAR?) Que contribuye a la diferenciación celular y tumorigénesis además de sus acciones metabólicas. En consecuencia, este estudio demuestra una extensa AS de
resto de pre-mRNA que redefine
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límite de genes y la estructura, junto con un enlace general, pero diferencial entre
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pre mRNA de empalme y varios tipos de cáncer. Estos hallazgos avanzar en nuestra comprensión de la compleja dependiente del contexto de la regulación,
resto de la expresión génica y la función, y ofrecer posibles biomarcadores y dianas terapéuticas para el cáncer
Visto:. Chen GL, GM Miller ( 2013) Amplia splicing alternativo del Elemento de silenciamiento factor de transcripción represor relacionado con el cáncer. PLoS ONE 8 (4): e62217. doi: 10.1371 /journal.pone.0062217
Editor: Emanuele Buratti, Centro Internacional de Ingeniería Genética y Biotecnología, Italia