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PLOS ONE: Identificación de nuevos genes candidatos y sustancias químicas relacionadas con el cáncer de esófago El uso de una red de interacción híbrido de sustancias químicas y proteínas


Extracto

El cáncer es una enfermedad seria responsable de muchas muertes cada año en los países desarrollados y en desarrollo. Una de las razones es que los mecanismos que subyacen a la mayoría de tipos de cáncer siguen siendo misteriosa, la creación de un gran bloque para el diseño de tratamientos eficaces. En este estudio, hemos tratado de aclarar el mecanismo subyacente cáncer de esófago mediante la búsqueda de nuevos genes y productos químicos. Con este fin, se construyó una red híbrida que contiene ambas proteínas y productos químicos, y generalizada de un método de cálculo existente utilizado anteriormente para identificar genes de la enfermedad para identificar nuevos genes candidatos y los productos químicos de forma simultánea. Basado en una prueba de navaja, nuestro método generalizado supera o al menos se realiza en el mismo nivel que los obtenidos por un método ampliamente utilizado - la caminata aleatoria con Restart (RWR). Los resultados del análisis de los genes obtenidos finales y productos químicos demostraron que la ontología términos de genes (GO) altamente compartidos y KEGG vías con las asociaciones directas e indirectas con cáncer de esófago. Además, también hablamos de la posibilidad de que los genes y los productos químicos que son nuevos genes y productos químicos relacionados con el cáncer de esófago candidatos seleccionados

Visto:. Gao YF, Yuan M, Liu J, Li LP, El YC, Gao RJ, et al. (2015) Identificación de nuevos genes candidatos y sustancias químicas relacionadas con el cáncer de esófago El uso de una red de interacción híbrido de sustancias químicas y proteínas. PLoS ONE 10 (6): e0129474. doi: 10.1371 /journal.pone.0129474

Editor Académico: Ying Xu, Universidad de Georgia, Estados Unidos

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