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PLOS ONE: Tumor contenido Gráfico Asistido HER2 /CEP17 Análisis de PCR digital de cáncer gástrico especímenes de biopsia


Extracto

La evaluación de
HER2
amplificación génica es un componente esencial de la toma de decisiones para el cáncer gástrico avanzado o metastásico terapéutico. Un método simple que es aplicable a, muestras pequeñas, fijadas en formalina embebidos en parafina de biopsia es deseable como un complemento de o como un sustituto para inmunohistoquímica HER2 se utilizan actualmente y en los protocolos de hibridación in situ. En este estudio, hemos desarrollado un método de PCR digital basada en la microfluídica para la determinación de
HER2 Opiniones y centrómero del cromosoma 17 (CEP17) en número de copias y la estimación de relación de contenido tumoral (TCR). El
relación HER2
/CEP17 está determinada por tres el número de copias absolutas de las variables-TCR y
HER2 Opiniones y CEP17-mediante el examen de las células tumorales; solamente la relación de los dos últimos se puede obtener por PCR digital utilizando toda la muestra sin purificar las células tumorales. TCR se determinó por análisis de imagen semi-automática. Hemos desarrollado una tabla de contenidos de tumor, que es un plano de coordenadas rectangulares que consiste en
los datos HER2
/CEP17 digital de PCR y TCR que delinea amplificadas y no amplificadas, y áreas equívocos. Mediante la aplicación de este método, 44 ​​clínicos muestras de biopsia de cáncer gástrico se clasificaron como amplificado (n = 13), no amplificado (n = 25), o equívoca (n = 6). En comparación, 11 muestras fueron positivas, 11 fueron negativos, y 22 eran equívocamente inmunohistoquímica. Por lo tanto, nuestro nuevo método reduce el número de muestras equívocos 22-6, obviando así la necesidad de confirmación por fluorescencia o de doble sonda de hibridación in situ a & lt; 30% de los casos. El análisis de PCR digital de tumor contenido de la carta-asistida es aplicable a múltiples sitios en los tejidos extirpados quirúrgicamente también. Estos resultados indican que este análisis es una alternativa útil a HER2 inmunohistoquímica en los cánceres gástricos que pueden servir de base para la evaluación automatizada de los
HER2
estado

Visto:. Matsusaka K, S Ishikawa, Nakayama A, Ushiku T, Nishimoto A, Urabe M, et al. (2016) Tumor contenido gráfico Asistida por
HER2 /CEP17
Análisis de PCR digital de cáncer gástrico especímenes de biopsia. PLoS ONE 11 (4): e0154430. doi: 10.1371 /journal.pone.0154430

Editor: Yves St-Pierre, INRS, Canada

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