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PLOS ONE: Asociación entre el polimorfismo Val762Ala PARP1 y riesgo de cáncer: La evidencia de 43 estudios


Extracto

Antecedentes

El poli (ADP-ribosa) polimerasa-1 (PARP-1) juega un papel crítico en la detección y reparación del ADN dañado, así como la proliferación celular y la muerte . Numerosos estudios han examinado la asociación entre
PARP1
Val762Ala (rs1136410 T & gt; C) polimorfismo y la susceptibilidad del cáncer; sin embargo, los resultados de los diferentes grupos de investigación siguen siendo controvertidos.

Métodos

Se buscaron las literaturas de MEDLINE, EMBASE y CBM en relación a tales asociaciones, y luego calcularon los odds ratio agrupado (OR) y el 95% intervalo de confianza (IC) mediante el uso del modelo de efectos aleatorios. Se utilizó el análisis de informes de probabilidad de falsos positivos (FPRP) para confirmar la validez de los hallazgos significativos. Por otra parte, los efectos potenciales de rs1136410 variantes en
PARP1
expresión del ARNm se analizaron por tres grupos étnicos mediante la combinación de datos de HapMap (genotipo) y SNPexp (expresión del ARNm).

Resultados

el meta-análisis final incorpora 43 estudios, que consta de 17,351 casos y 22.401 controles. En general, nuestros resultados no sugieren una asociación significativa entre la variante Ala (Ala /Ala o Ala /Val genotipo) y el riesgo de cáncer. Sin embargo, un análisis más detallado de estratificación mostró un aumento significativo del riesgo de cáncer gástrico (Ala /Ala vs. Val /Val: OR = 1,56, IC del 95% = 1,01-2,42, Ala /Val vs. Val /Val: OR = 1,34, IC del 95% = 1,14-1,58, modelo dominante: OR = 1,41, IC del 95% = 1,21-1,65 y Ala vs. Val: OR = 1,29, IC del 95% = 1,07-1,55). Por el contrario, la disminución del riesgo de tumor cerebral (Ala /Val vs. Val /Val: OR = 0,77, IC del 95% = 0,68 hasta 0,87 modelo, dominante: OR = 0,77, IC del 95% = 0,68 hasta 0,87 y Ala Val vs. : OR = 0,82, IC del 95% = 0,74-0,91). Adicionalmente, se encontró que los portadores Ala tenían un riesgo significativamente mayor en todos los modelos para los asiáticos. Nuestros datos de expresión de ARNm proporcionan más evidencia biológica para consolidar este hallazgo.

Conclusiones

A pesar de algunas limitaciones, este meta-análisis encontró evidencia de una asociación entre el
PAPR1
Val762Ala y susceptibilidad al cáncer en el cáncer gástrico, tumor cerebral y subgrupos asiáticos

Visto:. Hua RX, Li HP, Liang YB, Zhu JH, Zhang B, YE S, et al. (2014) Asociación entre la
PARP1
Val762Ala polimorfismo y el riesgo de cáncer: La evidencia de 43 estudios. PLoS ONE 9 (1): e87057. doi: 10.1371 /journal.pone.0087057

Editor: Balraj Mittal, del Instituto Médico Sanjay Gandhi, India

Recibido: 24 Octubre, 2013; Aceptado: 18 de diciembre de 2013; Publicado: 28 Enero 2014

Derechos de Autor © 2014 Hua et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan

Financiación:. Este estudio fue apoyado por becas de la Fundación Proyectos de Ciencia y Tecnología de la provincia de Guangdong (núm 2012B031800501) y la Fundación de Ciencias Naturales de la provincia de Guangdong (núm S2012010008827 y Nº S2011010005282). Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito

Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia

Introducción

la carga global del cáncer sigue aumentando, debido principalmente al envejecimiento y el crecimiento de las poblaciones de todo el mundo, los comportamientos que causan cáncer, tales como fumar y beber, así como la contaminación del medio ambiente. Como resultado, el cáncer se ha reconocido como una de las principales causas de muerte en el mundo ahora. De acuerdo con la estimación de GLOBOCAN, se habían producido aproximadamente 12,7 millones de nuevos casos y 7,6 millones de muertes de cáncer en 2008. Es de destacar que alrededor del 56% de los nuevos casos y el 63% de las muertes tuvieron lugar en los países en vías de desarrollo económico [1]. La supervivencia al cáncer tiende a ser más pobres en los países en desarrollo que en los países desarrollados, muy probablemente debido a la etapa avanzada al momento del diagnóstico combinado con acceso limitado a tratamiento oportuno y estándar. La carga del cáncer se pueden disminuir en gran medida a través de la aplicación de la detección temprana y el tratamiento, el control del tabaco, la inyección de la vacuna, la ingesta dietética saludable y así sucesivamente [2]. El cáncer puede ser iniciado por el daño del ADN causado por la exposición a una variedad de agentes ambientales, incluyendo UV, radiación ionizante, productos químicos genotóxicos y productos derivados de la respiración oxidativa, así como productos de la peroxidación lipídica que pueden producir alteraciones de la estructura del ADN. Sin embargo, la incidencia de cáncer es relativamente bajo, ya que los seres humanos han desarrollado una serie de sistemas de reparación del ADN para salvaguardar la integridad del genoma mediante la reparación de daños en el ADN perjudiciales. Por lo tanto, la capacidad de reparación del ADN juega un papel importante en el mantenimiento de la estabilidad y la integridad de genoma humano [3].

En los seres humanos, existen al menos cuatro vías de reparación del ADN, compuestos de más de 130 genes. Una de la vía de cuatro vías, la reparación por escisión de base (BER), es responsable de la reparación del ADN dañado como resultado de la exposición a diversos carcinógenos endógenos y exógenos. Esta vía elimina principalmente bases incorrectas y dañados, y puede eliminar específicamente metilados, oxidado, reducido o de una sola base par alteraciones [4]. Se ha comprobado que muchas proteínas están involucradas en la vía BER, uno de los cuales es el poli (ADP-ribosa) polimerasa miembro de la familia 1 (PARP1) que también se conoce como adenosina difosfato ribosil transferasa (ADPRT) [5].

El
PARP1
gen se encuentra en el cromosoma 1q41-q42, que codifica una proteína-poli (ADP ribosil) transferasa de unión al ADN dedo de zinc-113 KDa, que puede modificar diversas proteínas del núcleo de poli (ADP-ribosil) ación [6]. Las variaciones genéticas en los genes de reparación del ADN pueden modular la capacidad de reparación del ADN para dar lugar a la acumulación de daño en el ADN, en consecuencia, conduce a la muerte celular programada o crecimiento celular no regulado y el cáncer [7]. Hay por lo menos 1287 informaron de polimorfismos de nucleótido único (SNP) dentro de la
PARP1
gen, incluyendo 202-región de codificación de polimorfismos de nucleótido único (cSNPs). Entre todos cSNPs del
PARP1
gen, uno de los SNP más investigado es Val762Ala polimorfismo (rs1136410 T & gt; C) con una frecuencia menor alelo (MAF) & gt; 0,05. El muy SNP se encuentra en el sexto hélice del dominio catalítico, y puede causar Val a Ala sustitución de aminoácido en el codón 762 del exón 17. Los estudios anteriores demostraron que la
PARP1
Val762Ala polimorfismo estaba relacionado con la alteración funcional de PARP1, y el alelo Ala podría reducir significativamente poli (ADP-ribosil) ación actividades de PARP1 de una manera dosis-dependiente alelo [7]. Hasta la fecha, muchos estudios han explorado la asociación entre el
PARP1
Val762Ala polimorfismo y el riesgo Caner [7] - [45]; Sin embargo, los resultados fueron inconsistentes. Las discrepancias entre los estudios pueden atribuirse a los hechos que el tamaño de la muestra en cada publicación fue probablemente relativamente pequeña, y que las conclusiones podrían haber sido extraídos de diferentes grupos étnicos. Por lo tanto, hemos realizado la presente meta-análisis actualizado con la adición de nuevos estudios publicados sobre dicha asociación para aclarar aún más el papel de la
PARP1
Val762Ala polimorfismo en la susceptibilidad al cáncer.

Materiales y Métodos

Literatura estrategia de búsqueda

En primer lugar, las literaturas de MEDLINE y EMBASE utilizando los siguientes términos buscado "
PARP
o
PARP1
o
PARP-1
o
poli (ADP-ribosa) polimerasa 1

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