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PLOS ONE: Comparación de IHC, FISH y RT-PCR métodos de detección de reordenamientos en ALK 312 no microcítico de pulmón Los pacientes en Taiwán


Extracto

Antecedentes

Recientemente Equinodermo asociada a los microtúbulos semejante a la proteína cinasa del linfoma anaplásico 4- (
EML4-ALK
) gen de fusión se ha convertido en un biomarcador importante para ALK inhibidor de la tirosina quinasa del tratamiento (crizotinib) en el CPNM. Sin embargo, el mejor método de detección y la importancia de los
EML4-ALK
tipos de variantes siguen siendo inciertas.

Métodos

reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR), la fluorescencia La hibridación in situ (FISH) y la inmunohistoquímica mancha (IHC) se realizaron sobre los tejidos tumorales de 312 pacientes con CPNM para la detección de
ALK
reordenamientos. análisis de mutación para la
EGFR
y
también se realizaron KRAS
genes.

Resultados

Trece de los 312 pacientes (4,17%) tenían
ALK
reordenamientos detectados por RT-PCR. Si se ha utilizado datos de RT-PCR como el estándar de oro, las pruebas de pescado tuvieron una baja sensibilidad (58,33%), pero muy buena especificidad (99,32%). IHC mancha tenía una mejor sensibilidad (91,67%) de los peces, pero menor especificidad (79,52%), cuando el corte fue fuera IHC2 +. Todos los 8 pacientes con alta abundancia de
EML4-ALK
células positivas en los tejidos tumorales (evaluados por la intensidad de señal del producto de RT-PCR), fueron también tienen una alta expresión de la proteína ALK (IHC3 +) y positivo para FISH, excepto uno fallaron en el pescado. Variantes 3a + 3b (4/5, 80%) de
EML4-ALK
gen de fusión fueron más comunes para tener una alta abundancia de
EML4-ALK
células positivas en los tejidos tumorales que la variante 1 ( 1/3, 33,3%). El metanálisis de los datos publicados de 2273 pacientes con CPNM reveló que la variante 3 (23/44, 52,3%) era el tipo más común en la población china, mientras que la variante 1 (28/37, 75,7%) fue más común en caucásicos.

Conclusiones

Entre los tres métodos de detección, RT-PCR podría detectar no sólo la presencia de
EML4-ALK
gen de fusión y sus tipos de variantes, sino que también la abundancia de
EML4-ALK
células positivas en los tejidos tumorales de NSCLC. Los dos últimos factores pueden afectar la respuesta al tratamiento con inhibidor anti-ALK. Se recomienda incluyendo RT-PCR como una prueba de diagnóstico para el tratamiento inhibidor de ALK en los ensayos clínicos prospectivos

Visto:. Wu Y-C, Chang I-C, Wang C-L, Chen T-D, Chen Y-T, Liu H-P, et al. (2013) Comparación del IHC, FISH y métodos de RT-PCR para la detección de
ALK
reordenamientos en 312 para no microcítico de pulmón Los pacientes en Taiwán. PLoS ONE 8 (8): e70839. doi: 10.1371 /journal.pone.0070839

Editor Syed A. Aziz, Health Canada y la Universidad de Ottawa, Canada

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