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PLOS ONE: Análisis cuantitativo de metilación del ADN de genes candidatos en el cáncer cervical


Extracto

metilación aberrante del ADN se ha observado en el cáncer de cuello uterino; Sin embargo, la mayoría de los estudios han utilizado métodos no cuantitativos para medir la metilación del ADN. El objetivo de este estudio fue cuantificar la metilación dentro de un selecto grupo de genes previamente identificados como objetivos para el silenciamiento epigenético en cáncer de cuello uterino e identificar los genes con metilación elevada que puede distinguir el cáncer del cuello del útero de los tejidos normales. Se identificaron 49 mujeres con cáncer invasivo de células escamosas del cuello uterino y 22 mujeres con muestras de citología normales. ADN genómico modificado con bisulfito se amplificó y pirosecuenciación cuantitativa completada por 10 genes (
APC
,
CCNA
,
CDH1
,
CDH13
,
WIF1
,
TIMP3
,
DAPK1
,
RARB
,
FHIT
, y
SLIT2
). Un Índice de metilación se calculó como el porcentaje de metilación Medio en todos los sitios CpG analizadas por gen (~ 4-9 CpG sitio) por secuencia. Un punto de corte binario se definió en & gt; 15% de metilación. Se examinó la sensibilidad, especificidad y el área bajo la curva ROC (AUC) de la metilación en genes individuales o un panel. El índice de metilación mediana fue significativamente mayor en los casos en comparación con los controles en 8 genes, mientras que no hubo diferencias en la metilación mediana para 2 genes. En comparación con el VPH y la edad, la combinación de nivel de metilación del ADN de
DAPK1
,
SLIT2
,
WIF1
y
RARB
con el VPH y la edad mejoraron significativamente las AUC 0,79-0,99 (IC del 95%: 0,97 a 1,00,
p-valor = 0,003
). pirosecuenciación análisis confirmó que varios genes son objetivos comunes para la metilación aberrante en el cáncer y el nivel de metilación del ADN cervical de cuatro genes parece aumentar la especificidad para identificar el cáncer en comparación con la detección del VPH. Las alteraciones en la metilación del ADN de genes específicos en los cánceres de cuello uterino, como
DAPK1
,
RARB
,
WIF1
, y
SLIT2
, también puede ocurrir temprano en la carcinogénesis cervical y deben ser evaluados

Visto:. Siegel EM, Riggs BM, Delmas AL, Koch a, a Hakam, Brown KD (2015) Análisis cuantitativo de metilación del ADN de genes candidatos en el cáncer cervical. PLoS ONE 10 (3): e0122495. doi: 10.1371 /journal.pone.0122495

Editor Académico: Osman El-Maarri, Universidad de Bonn, Instituto de Hematología Experimental y Medicina de Transfusión, Alemania

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