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PLOS ONE: Asociación entre el ADN de respuesta y reparación de daños de genes y el riesgo del cáncer invasor seroso de ovario


Extracto

Antecedentes

Se analizó la asociación entre el 53 genes relacionados con la reparación del ADN y la respuesta al daño mediado por p53 y la serosa del riesgo de cáncer de ovario a partir de datos de casos y controles del cáncer ovárico de Carolina del Norte estudio (NCOCS), un estudio de casos y controles de base poblacional.

Métodos /Principales conclusiones

El análisis se restringió a 364 casos de cáncer de ovario seroso invasivos y 761 controles de blanco, no raza hispana. El análisis estadístico fue en dos etapas: una pantalla utilizando factores marginales Bayes (BFS) a 484 SNPs y una etapa de modelado en el que se calculó multivariados posterior probabilidades de asociación para 77 SNPs que pasaron la pantalla. Estas probabilidades estaban condicionadas a la edad del sujeto al momento del diagnóstico /entrevista, por lotes, una calidad métrica de ADN y otros genotipos de SNP y permitieron la incertidumbre en las parametrizaciones genéticos de los SNPs y el número de SNPs asociados. Seis SNPs tenían factores de Bayes mayor que 10 a favor de una asociación con el cáncer de ovario seroso invasiva. Estos rs5762746 incluidos (mediana O (odds ratio)
por cada alelo = 0,66; 95% intervalo de credibilidad (IC) = 0,44-1,00) y rs6005835 (
mediana
O
alelo por
= 0,69; IC del 95% = 0,53-0,91
) en
CHEK2
, rs2078486 (mediana O
por cada alelo = 1,65; IC del 95% = 1.21 a 2.25) y rs12951053 (mediana O
por alelo = 1,65; IC del 95% = 1.20 a 2.26) en
TP53
, rs411697 (mediana O
raros homocigotos = 0,53; IC del 95% = 0,35 - 0,79) en
BACH1
y rs10131 (
mediana O
homocigoto rara = de
no estimable) en
LIG4
. Los seis SNPs más altamente asociados o bien se prevé que sea funcionalmente significativa o están en LD con una variante de este tipo. Las variantes en TP53 se confirmaron a asociarse en un gran estudio de seguimiento.

Conclusiones /Importancia

En base a los resultados, un seguimiento posterior de las vías de reparación del ADN y la respuesta en una mayor conjunto de datos está garantizado para confirmar estos resultados

Visto:. Schildkraut JM, Iversen eS, Wilson MA, MA Clyde, Moorman PG, Palmieri RT, et al. (2010) Asociación entre la respuesta al daño del ADN y los genes de reparación y de riesgo de enfermedad invasiva por cáncer de ovario seroso. PLoS ONE 5 (4): e10061. doi: 10.1371 /journal.pone.0010061

Editor: Marie-Pierre Dubé, Université de Montréal, Canada

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