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PLOS ONE: Distintos de alto perfil genes metilados en el cáncer colorrectal


Extracto

Antecedentes

Las mutaciones y la metilación de los promotores de un conjunto de genes del cáncer candidato (CAN genes) están asociados con la progresión del cáncer colorrectal (CCR). La hipótesis de que los promotores de estos genes se inactivan a través de silenciamiento epigenético y pueden mostrar un perfil diferente en poblaciones de alto riesgo. Se investigó el estado de metilación del gen de la CAN y la expresión de proteínas CHD5 en microarrays de tejidos CRC afroamericano (TMA) mediante tinción inmunohistoquímica.

Metodología /Principales conclusiones

El estado de metilación del promotor de los genes de la CAN tuvo estudiados por PCR específica de metilación (MSP) en 51 iraníes (una población blanca) y 51 afroamericanos (AA). Inestabilidad de microsatélites (MSI) se analizó también. La frecuencia diferencial de metilación para cada gen se puso a prueba mediante análisis de chi-cuadrado entre los dos grupos en función de la edad y el sexo emparejado. expresión de la proteína se evaluó en CHD5 moderada a carcinomas bien diferenciados y pobremente diferenciados en comparación con el tejido normal correspondiente usando TMA. Además, se analizó la correlación entre estos biomarcadores epigenéticos y diversos factores clínico-patológicos, incluyendo, edad, ubicación y etapa de la enfermedad.

El setenta y siete y el 34% de los tumores eran distal en pacientes americanos y africanos iraníes , respectivamente. En ambas poblaciones, el porcentaje de metilación era & gt; 65% para SYNE1, MMP2, APC2, GPNMB, EVL, PTPRD, y STARD8, mientras que la metilación fue & lt; 50% para Lgr6, RET, CD109, y RNA. La diferencia en la metilación entre las dos poblaciones fue estadísticamente significativa para CHD5, ICAM5 y GPNMB. Treinta y un por ciento de los tumores de AA mostraron MSI-H, comparado con el 28% de los iraníes.

Conclusiones /Importancia

Una significativa se encontró una mayor tasa de metilación de genes GPNMB, ICAM5, y CHD5 en AA los pacientes en comparación con los iraníes. Estos genes pueden jugar un papel en la alta incidencia y agresividad de CRC en la población AA. La hipermetilación de los genes se puede considerar como un marcador de la carcinogénesis de colon

Visto:. Mokarram P, K Kumar, Ala H, F Naghibalhossaini, Saberi-Firoozi M, Nouraie M, et al. (2009) Distintos de alto perfil genes metilados en el cáncer colorrectal. PLoS ONE 4 (9): e7012. doi: 10.1371 /journal.pone.0007012

Editor: Ulrich Zanger, el Dr. Margarete Fischer-Bosch Instituto de Farmacología Clínica, Alemania

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