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PLOS ONE: Expresión Génica Los meta-análisis identifica VDAC1 como un predictor de resultados pobres en la etapa temprana de células no pequeñas cáncer de pulmón


Extracto

Antecedentes

El estado bioenergético de cáncer de pulmón de células no pequeñas se correlaciona con la agresividad del tumor. El canal de aniones dependiente de voltaje de tipo 1 (VDAC1) es un componente del poro de transición de permeabilidad mitocondrial, regula mitocondrial intercambio ATP /ADP lo que sugiere que su sobre-expresión podría estar asociada con procesos dependientes de energía, incluyendo aumento de la proliferación y la invasividad. Para probar esta hipótesis, se realizó una expresión de genes de meta-análisis in vivo de cáncer sometidos a resección quirúrgica de pulmón no microcítico (CPNM) con 602 perfiles de expresión individual, para examinar el impacto de VDAC1 en la supervivencia.

Metodología /Principales conclusiones

la expresión de alto VDAC1 se asoció con una menor supervivencia global con la razón de riesgo (HR) = 0,6639 (95% intervalo de confianza (IC) del 0.4528 a 0.9721), p = 0,035352 correspondiente a 52 frente a 101 meses. VDAC1 predijo tiempo más corto hasta la recurrencia y ha demostrado ser un factor pronóstico independiente en comparación con la histología, el género, la edad, estadio ganglionar y el estadio tumoral en un análisis multivariado de Cox. análisis supervisado de todos los conjuntos de datos identificados de una firma de 6 génica que comprende HNRNPC, hspa4, HSPA9, UBE2D2, CSNK1A1 y G3BP1 con funciones que implican la regulación del recambio de proteínas, vía RAS-RAF-MEK y la transcripción de la superposición. VDAC1 predice la supervivencia en el cáncer de mama y mieloma y un análisis sin supervisión reveló el enriquecimiento de la firma VDAC1 en subgrupos específicos.

Conclusiones

En resumen, el análisis de la expresión génica identifica la expresión génica VDAC1 como un predictor de mal resultado en el CPNM y otros tipos de cáncer y se asocia con la desregulación de un conjunto de vías biológicas conservadas, que pueden estar causalmente asociada con el comportamiento agresivo del tumor

Visto:. Parrillas C, Jithesh PV, Blayney J, Zhang SD, Fennell DA (2011) Expresión génica Meta-análisis identifica VDAC1 como un predictor de resultados pobres en la etapa temprana de células no pequeñas cáncer de pulmón. PLoS ONE 6 (1): e14635. doi: 10.1371 /journal.pone.0014635

Editor: Rory Edward Morty, Universidad de Giessen Centro de pulmón, Alemania

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