Extracto
Antecedentes
BRAF
mutaciones han sido bien describen en el cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC) durante varios años, pero las características clínicas de los pacientes que albergan
BRAF mutaciones
todavía no están bien descritas. Se realizó un meta-análisis para identificar las características clínicas comunes en pacientes con CPNM que llevan
BRAF
mutaciones.
Métodos
Se identificaron estudios clínicos que examinaron la asociación entre el
BRAF
mutaciones y características de NSCLC en PubMed, Embase y la base de datos ISI Science Citation Index hasta octubre de 2013. La magnitud del efecto de las características clínicas se estimó mediante la odds ratio (OR) con intervalo de confianza del 95% (IC) para cada estudio, el uso de un modelo de efectos fijos o de efectos aleatorios.
resultados
se incluyeron diez estudios con un total de 5599 pacientes con CPNM. Hubo un (170/5599)
BRAF
tasa de mutación del 3%.
BRAF
mutaciones en el CPNM se asociaron significativamente con adenocarcinomas (ADC) (en comparación con los no-ADC, OR = 4,96, IC del 95% = 2,29 a 10,75). No hubo diferencias significativas en cuanto al sexo, el tabaquismo y la etapa en pacientes con y sin
BRAF
mutaciones. El
BRAF
mutación V600E fue más frecuente en las mujeres que no
BRAF
mutaciones V600E (OR = 0,27, 95% CI = 0,12-0,59), y estaba estrechamente relacionados con no fumadores (OR = 0,14, IC del 95% = 0,05 a 0,42).
conclusiones
Estos resultados tienen implicaciones importantes para la predicción de los subtipos de NSCLC combinado con mayor precisión con otra cambios genéticos
Visto: D. Chen, Zhang LQ, Huang JF, Liu K, Chuai ZR, Yang Z, et al. (2014)
BRAF
Las mutaciones en pacientes con células no pequeñas de cáncer de pulmón: una revisión sistemática y meta-análisis. PLoS ONE 9 (6): e101354. doi: 10.1371 /journal.pone.0101354
Editor: John Souglakos, Hospital General Universitario de Heraklion y Laboratorio de Biología de Células Tumorales, Escuela de Medicina de la Universidad de Creta, Grecia
Recibido: Diciembre 9, 2013; Aceptado: 6 Junio 2014; Publicado: 30 de junio 2014
Derechos de Autor © 2014 Chen et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Este trabajo fue apoyado en parte por subvenciones del Programa de Investigación y Desarrollo de alta Tecnología Nacional de China (Programa Nacional 863, Nº 2011AA02A121 y 2013AA020204) la Fundación preferencial de Ciencia y Tecnología Actividades para estudiantes en el extranjero de Chongqing (núm YuLiuZhu201201), el Proyecto patrocinado por la Fundación de Investigación Científica de Ultramar Repatriados los estudiosos chinos del Ministerio de Educación del Estado. Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el cáncer de pulmón es la principal causa de muerte por cáncer, cada año resulta en más de un millón de muertes en todo el mundo [1]. Aproximadamente el 85% de los pacientes con cáncer de pulmón tienen un diagnóstico histológico de cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC), y la tasa de supervivencia global a los 5 años es de alrededor del 17% [2], [3]. Las decisiones de tratamiento para los pacientes con cáncer de pulmón históricamente se han basado en la histología del tumor. Una estrategia de tratamiento prometedor se ha centrado en la mayor subdivisión de NSCLC en subgrupos moleculares clínicamente relevantes. El esquema de clasificación se basa en mutaciones del conductor llamados específicos, incluyendo la activación de mutaciones en el receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR),
KRAS
,
BRAF
,
HER2
,
PIK3CA
, y otros en frecuencias superiores a 1% [4], [5]. Además, Seidel et al. han predicho con éxito cada uno de los subtipos de NSCLC mediante el uso de una combinación de técnicas de inmunohistoquímica y marcadores genómicos [6]
BRAF
, uno de los tres miembros de la familia de quinasas RAF:.
a-RAF
,
BRAF
,
C-RAF
, pertenece al grupo de las serina-treonina quinasas y juega un papel vital en activada por mitógenos proteína quinasa (MAPK) vías [7 ], [8]. Las mutaciones en
BRAF
se ha encontrado en diferentes tipos de cáncer, principalmente de melanoma, el cáncer colorrectal metastásico y el cáncer papilar de tiroides. La frecuencia de mutación ha sido aproximadamente 50%, 9% y 45%, respectivamente [9] - [11].
BRAF
se encontraron mutaciones en el 1-3% de NSCLC [4].
Las mutaciones en los genes anteriores están estrechamente relacionadas con las características demográficas o clínico-patológicas específicas, incluyendo los hábitos de fumar, el género, la clínica etapa, y la histología del tumor [12], [13]. Esta información puede ser útil para la selección de pacientes para el tratamiento con inhibidores de genes específicos. Mientras que
BRAF
mutaciones en el CPNM se han descrito desde hace varios años, la prevalencia real y las características clínicas de los pacientes con CPCNP que albergan
BRAF
mutaciones no están bien definidos debido al número relativamente bajo de pacientes los casos investigados [14] - [16]
Se realizó un meta-análisis de un gran número de tumores de pulmón con
BRAF
mutaciones de los estudios publicados con el fin de revisar cuantitativamente la asociación entre
BRAF
mutación y las características demográficas o clínico-patológicas.
Materiales y Métodos
Búsqueda de publicaciones
Se realizó una búsqueda sistemática de la literatura en PubMed, EMBASE, y el bases de datos Science Citation Index. Se utilizaron los siguientes términos de búsqueda para identificar publicaciones relevantes: "
BRAF
", "
B-RAF
", "el cáncer no microcítico de pulmón de células" ", el carcinoma no microcítico de pulmón de células" , "no-carcinoma de células pequeñas", "NSCLC", "cáncer de pulmón de células escamosas", "de células escamosas carcinoma de pulmón", "cáncer de pulmón de células grandes", "carcinoma de pulmón de células grandes", "adenocarcinoma de pulmón". La búsqueda bibliográfica se limita a los estudios en humanos. No se han impuesto limitaciones en el idioma de publicación o tipo de estudio. Se recuperaron todos los estudios elegibles, y sus bibliografías se revisaron para otras publicaciones pertinentes. Los artículos de revisión y bibliografías de otros estudios relevantes identificados se realizaron búsquedas manuales para encontrar estudios elegibles adicionales.
Los criterios de inclusión
Los estudios elegibles para su inclusión en este metanálisis (1) fueron publicados como un texto completo en inglés. (2) el número de pacientes con
BRAF mutaciones
era superior a 1; (3) los artículos tenían que ver con la relación entre el
BRAF Opiniones y características demográficas o clínico-patológicas de NSCLC. Cuando el mismo autor o grupo informó de los resultados de la misma población de pacientes en más de un artículo, se incluyó el informe más reciente o el más informativo.
Datos de extracción
Información se extrajo cuidadosamente todos los estudios elegibles. Los siguientes datos fueron recogidos de cada estudio: en primer lugar, nombre del autor, año de publicación, número de pacientes incluidos, el número de pacientes con
BRAF mutaciones
, el número de pacientes con
BRAF
V600E mutaciones, procedimientos de selección, las características demográficas y clínico-patológicas de los pacientes. La extracción de datos fue realizada en forma independiente por dos de los autores y las discrepancias se resolvieron por consenso que incluye un tercer autor. Todos los procedimientos se ajustaban a las directrices para el meta-análisis de estudios observacionales en epidemiología [17].
Métodos estadísticos
Se utilizó RevMan (versión 5) para calcular los odds-ratios ( OR) con intervalos de confianza del 95% (IC), utilizando un modelo de efectos aleatorios o fijos para todos los análisis. Se evaluó la heterogeneidad de los estudios mediante la prueba de chi-cuadrado de heterogeneidad y el I
2 medida de la incompatibilidad. La heterogeneidad significativa se definió como un valor de P & lt prueba de chi-cuadrado; 0,10 o como un I
2 medida de & gt; 50% [18]. Si no se encuentra RUP tener bien homogeneidad (I
2≤50%), se utilizó un modelo de efectos fijos para el análisis secundario. Si no es así (I
2 & gt; 50%), se utilizó un modelo de efectos aleatorios. Se realizó un análisis de sensibilidad para examinar la influencia de cada estudio sobre la agrupada u omitiendo en serie un estudio individual y la combinación de los estudios restantes. Posible sesgo de publicación se evaluó mediante la evaluación visual de un gráfico en embudo. Los análisis de subgrupos se realizaron por el origen étnico y el número de
BRAF
mutaciones.
Resultados
Selección de los estudios
Se obtuvieron un total de 1480 resúmenes y los títulos a través electrónica búsquedas. 349 registros fueron excluidos debido a los duplicados. Los registros restantes 1131 fueron seleccionadas por los títulos y los resúmenes y 1088 los estudios fueron excluidos. 43 documentos de texto completo se consideraron relevantes y se examinaron en detalle. 33 de estos artículos de texto completo fueron excluidos (Figura 1). Diez estudios cumplieron los criterios de inclusión y fueron incluidos en el meta-análisis
Características de los Estudios
Hubo 5599 pacientes en los estudios identificados 10 [5], [14] -. [ ,,,0],16], [19] - [24]. Sólo 170 (3,0%) de estos pacientes tenían
BRAF
mutaciones en los tumores de NSCLC (Tabla 1). El primer estudio fue en noviembre de 2008 por Pratilas et al. [19], mientras que el último estudio fue en agosto de 2013, por Cardarella et al. [5]. El tamaño de la muestra varió de 96 a la 1046, con sólo un estudio de más de 1000 pacientes [16]. La incidencia de
BRAF
mutaciones en los estudios individuales varió de 0,9% a 8,9%. Los pacientes en cuatro estudios eran asiáticos, cinco estudios eran no-asiática, y un estudio consistieron en una población mixta de 4 países. Cinco estudios seleccionados para
BRAF
mutaciones utilizando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y secuenciación directa. Tres estudios detectaron la
BRAF
mutaciones utilizando los métodos anteriores, además de la matriz de desorción láser asistida /tiempo de ionización de espectrometría de masas de vuelo (MALDI-TOF MS), análisis de polimorfismo de conformación de cadena única (SSCP), o el análisis de fusión de alta resolución (HRMA). Los dos estudios restantes utilizaron los métodos individuales MALDI-TOF MS o HRMA.
BRAF
mutaciones y características demográficas y clínico-patológicas de NSCLC
Los resultados combinados de la asociación entre
BRAF
mutaciones y características demográficas y clínico-patológicas de NSCLC se presentan en la Tabla 2 y Figura 2. Nueve estudios presentaron datos sobre la asociación entre
BRAF
mutaciones y de género.
se detectaron mutaciones de BRAF
en 83 de 2.224 pacientes del sexo masculino (3,73%) y 79 pacientes de sexo femenino, de 1972 (4.01%). No hubo diferencia significativa en la frecuencia de mutación por género (OR = 0,79, IC del 95% = 0,57-1,10). Los datos relativos a la asociación entre el
BRAF
mutaciones y fumar se presentan en ocho estudios.
se detectaron mutaciones de BRAF
en 120 de 2557 los fumadores actuales o anteriores (4,69%) y 38 de 1248 que nunca habían fumado (3,04%). No hubo diferencia significativa en
BRAF
tasa de mutación en los fumadores o ex fumadores y nunca (OR = 0,95, IC 95% = 0.45-2.02). Seis estudios informaron la asociación entre el
BRAF
mutación y la histología del tumor.
BRAF
mutaciones se detectaron en 98 (4,04%) de 2224 ADC y 6 (0,58%) de 1037 no ADCs. No hubo diferencias significativas entre los ADC y no ADC en
BRAF
tasa de mutación (OR = 4,96, IC del 95% = 2,29 a 10,75). Sólo cuatro estudios contenían información sobre el estadio clínico del NSCLC con
BRAF
mutaciones.
se detectaron mutaciones de BRAF
en 46 de 1.132 pacientes con estadio I o II (4,06%) y 71 de 931 en pacientes con estadio III o IV (7,63%). No hubo diferencia significativa en el
BRAF
tasa de mutación en la etapa I y II y fase III y IV (OR = 1,05, IC del 95% = 0,55-2,01).
características BRAF
mutación V600E y demográficas y clínico-patológicas
La asociación de
BRAF
se evaluó
mutación V600E y las características demográficas y clínico-patológicas (Figura 3). Tres estudios que evalúan el
BRAF
mutación V600E en el CPNM fueron sistemáticamente analizados utilizando un modelo de efectos fijos.
mutaciones BRAF
V600E representaron el 53,6% (60/112) de todos los
BRAF
mutaciones.
BRAF
se detectaron mutaciones V600E en 23 de los 60 pacientes del sexo masculino (38,3%) y 37 de 52 pacientes de sexo femenino (71,2%). Hubo una diferencia significativa en la expresión de macho y hembra de esta mutación (OR = 0,27, IC del 95% = 0,12-0,59). De 84 fumadores actuales o anteriores, 36 (42,9%) tenían
mutaciones BRAF
V600E. 24 de 28 que nunca habían fumado (85,7%) tenían esta mutación. La diferencia fue significativa entre los fumadores actuales o ex fumadores y nunca (OR = 0,14, IC 95% = 0.05-0.42).
se detectaron mutaciones de BRAF
en 20 de los 42 pacientes con enfermedad en estadio I o II (47,6%) y 40 de 70 en pacientes con estadio III o IV (57,1%) la enfermedad. No hubo diferencia significativa en la expresión de esta mutación en los dos grupos de etapa (OR = 0,54, IC del 95% = 0,23-1,28).
Los análisis de subgrupos de los
BRAF mutaciones y
características demográficas y clínico-patológicas
Cuando los estudios combinados incluidos fueron estratificados según el grupo étnico, no hubo asociaciones estadísticamente significativas entre los
BRAF
mutación y de género, historia de tabaquismo o etapa, de acuerdo con el efecto global (Tabla S1). Sin embargo, el OR de la histología (IC del 95%: 0,79 a 15,45) 3,49 para los asiáticos, (IC del 95%: 0,94 a 35,25) 5,75 para los no asiáticos, y 3,59 (IC del 95%: 0,82 a 15,80) para el origen étnico mixto. No hubo asociación estadísticamente significativa entre el
BRAF
mutación y ADC, que era diferente del efecto global (OR = 4,96, IC del 95% = 2,29 a 10,75). Del mismo modo, cuando los estudios se agruparon por el número de
BRAF mutaciones
, el OR combinado para histología fue (IC del 95%: 0,79 a 15,45) 3.49 para un menor número de mutaciones (& lt; 10). En este subgrupo
BRAF
mutaciones se asocian más frecuentemente con ADC. (Tabla S1).
Análisis de sensibilidad y sesgo de publicación
Se realizó un análisis de sensibilidad para determinar si la modificación de los criterios de inclusión de este meta-análisis afectó a los resultados finales. El análisis de sensibilidad reveló que ninguno de los estudios afectó significativamente las RUP y IC agrupados (datos no presentados). Para investigar la presencia de sesgo de publicación, un gráfico en embudo de los efectos calculados a partir de los estudios individuales que examinaron la asociación entre el
se realizó BRAF
mutaciones y características demográficas o clínico-patológicas. No había ninguna indicación fuerte de sesgo de publicación entre los estudios incluidos en este meta-análisis.
Discusión
Los estudios de mutaciones del considerable interés
BRAF
gen han generado debido a que estos Las mutaciones pueden estar asociados con un aumento de la sensibilidad a los agentes directamente dirigidas a
BRAF
o
BRAF
mediados por vías de señalización corriente abajo [25].
BRAF
mutaciones han sido analizados utilizando estudios de meta-análisis en el melanoma, el cáncer colorrectal y el cáncer papilar de tiroides [26] - [29]. Las mutaciones en el gen
BRAF
estaban estrechamente relacionados con determinadas características demográficas o clínico-patológicas, incluyendo el hábito de fumar, el género, el estadio clínico, diferencial y la histología del tumor. El efecto de
BRAF
mutaciones en las características clínicas de NSCLC se ha informado desde hace varios años. Un consenso no se ha alcanzado debido al pequeño número de pacientes evaluados. Se realizó este meta-análisis para investigar la prevalencia y características de los pacientes con CPNM con
BRAF
mutaciones en una gran muestra conjunta de los pacientes.
Revisión sistemática de la literatura que describe la relación entre el
BRAF
mutaciones y características demográficas o clínico-patológicas de 10 estudios que incluyeron más de 5500 pacientes con NSCLC. La tasa de
BRAF mutaciones
fue, en promedio, alrededor del 3% (170/5599), de acuerdo con los datos publicados anteriormente [4], [7], [21]. La tasa de mutación de los estudios publicados varió de 0,9% a 8,9% [20], [24]. Ilie et al. explicó la variación puede deberse a la evaluación exclusiva de
BRAF
mutación en pacientes caucásicos con
EGFR
,
KRAS
,
PI3KCA
,
HER2
o
ALK
alteraciones [24]. Las tasas de mutación de 2% y el 3,5% fueron reportados por Pratilas et al y Marchetti et al. en serie compuesta de 916 y 1046 pacientes, respectivamente [16], [19]. Estos fueron cerca de la frecuencia encontrada en nuestro estudio
.
Uno de los objetivos de nuestro estudio fue identificar características que ayudan a enriquecer los pacientes para el análisis de mutación del tumor. El meta-análisis se llevó a cabo para encontrar una asociación entre el
BRAF
mutación y cuatro características clínico. No hubo asociación significativa con el género y la incidencia de
BRAF mutación
(OR = 0,79 IC 95% = 0,57-1,10). Una asociación entre
BRAF
mutaciones y femenina ha sido reportada en pacientes con cáncer colorrectal [29] - [31]. Sin embargo, esta asociación no se ha hecho para NSCLC [5], [24], lo que corrobora con nuestros resultados. Los análisis de subgrupos según la etnia encuentra una débil asociación con los asiáticos tienen una propensión ligeramente mayor de tener
BRAF
mutación, pero esto no fue estadísticamente significativa. La mayoría de los estudios también mostraron ninguna asociación de
BRAF
estado de la mutación y el tabaquismo. Sin embargo, Paik et al informaron de que todos los pacientes con un
BRAF mutación
eran fumadores actuales o anteriores [21]. Sin embargo vemos tal asociación en este análisis.
En los últimos años, los científicos han hecho grandes progresos en la comprensión de mutaciones específicas del cáncer y de orientación con los medicamentos apropiados [6]. Seidel et al. realizado un gran trabajo con los estudios de dos cohortes incluyendo más de 6000 pacientes con cáncer de pulmón, y demostró la asociación entre el subtipo de tumor de pulmón y sus mutaciones predominantes, y el beneficio de las pruebas genéticas y la terapia dirigida en estos pacientes [6]. Ellos encontraron que la mayoría de mutaciones mostraron especificidad subtipo histológico y proporcionan un modelo para el diagnóstico genómico de tumores de pulmón [6]. Por lo tanto, también se realizó el metanálisis para fundar la asociación entre la mutación BRAF y el subtipo histológico y el estadio clínico de NSCLC.
CPNM se compone de tres tipos histológicos diferentes, el carcinoma de células escamosas, carcinoma de células grandes, y ADC. cuentas de ADC de más del 50% de todos los casos. Hemos encontrado que
BRAF
mutaciones en su conjunto eran más comunes en los ADCs que en otras histologías (OR = 4,96 IC 95% = 2.29-10.75), similar a un estudio previo [16]. No hubo heterogeneidad significativa entre los estudios (I
2 = 0,0%, p = 0,70). Un resultado interesante de nuestro estudio es que los resultados agrupados en el subgrupo estratificada por etnia y el número de mutaciones fueron significativamente diferentes de los efectos generales de la histología (Tabla S1). No hubo diferencia significativa en la tasa de
BRAF
mutaciones y ADC en el subgrupo, mientras que las diferencias fueron significativas en la población general del paciente. Esto puede explicarse por el número de casos incluidos. Cuando el número de pacientes fue pequeño en el subgrupo, la asociación no fue significativa. Cuando investigamos esta asociación en un gran número de pacientes, hubo una mayor potencia para detectar la asociación entre el
BRAF
mutación y ADC. Este es el hallazgo más valioso de este estudio. El estadio clínico es un factor importante en la determinación del pronóstico de NSCLC. No se encontró asociación significativa entre la baja o alta escenario y
BRAF
mutación. Se necesitan estudios más amplios para examinar mejor esta relación.
Entre las diferentes mutaciones que se producen en el
BRAF
gen,
BRAF
V600E es el más común [32] . Hasta el momento tres estudios han investigado la asociación entre el
BRAF
mutación V600E y las características demográficas o clínico-patológicas [5], [16], [24]. El número de mutaciones V600E y no V600E detectados fue baja, no que nos permite realizar un analizan por separado en otros estudios. Los tres estudios encontraron diferencias significativas en las características clínicas de los pacientes con CPNM con y sin
BRAF
V600E [5], [16], [24]. Dos informes encontrados
BRAF
mutaciones V600E con mayor frecuencia en las mujeres y nunca fumadores, y no con cualquier otro características clínico [16], [24]. También encontramos que el
BRAF
mutación V600E fue significativamente más frecuente en las mujeres. El
BRAF
mutación V600E también fue significativamente más frecuente en los no fumadores en comparación con los fumadores actuales o anteriores (OR = 0,14 IC 95% = 0.05-0.42). Ilie et al informaron de que no
BRAF
mutaciones V600E se asociaron significativamente con tumores en estadio temprano [24]. Nos hicieron ver una tendencia para la enfermedad en estadio temprano, pero eso no fue estadísticamente significativa.
La heterogeneidad es un problema potencial que puede afectar a la interpretación de todos los metanálisis. Para investigar las posibles fuentes de heterogeneidad que podrían modificar los efectos de la
BRAF mutaciones
al consumo de tabaco y de la etapa, se realizó el análisis de subgrupos según el origen étnico y el número de
BRAF
mutaciones. Los resultados en la fase de fumar y no se modificaron sustancialmente, como se indica por subgrupos y análisis de sensibilidad. El análisis de subgrupos según la etnia no demostró heterogeneidad clínica con respecto a la asociación entre el
BRAF
mutaciones y sexo, tabaquismo o el escenario. Esto indica que la estimación general de la asociación entre el
BRAF
mutaciones y las características clínicas de NSCLC es legítimo.
Nuestro estudio tiene varias limitaciones que deben ser tenidas en cuenta a la hora de interpretar los resultados. En primer lugar, el número de estudios incluidos fue pequeña. Se necesitan más estudios para ampliar y confirmar nuestros resultados. En segundo lugar, no recogimos datos sobre el tratamiento y los resultados clínicos de los pacientes con
BRAF
mutaciones que se harán en un futuro estudio. Por último, no se describe la asociación entre la mutación BRAF y el hábito de fumar, que agrupa por los fumadores actuales y anteriores por separado debido a la falta de los datos.
Conclusiones
A pesar de las limitaciones, nuestra meta-análisis tenido algunos resultados significativos. Hemos encontrado que
BRAF
mutaciones fueron más frecuentes en los ADC, y no se asociaron con otros tipos histológicos. El BRAF
mutación V600E se correlacionó significativamente con los pacientes con CPNM femeninos y no fumador. Las conclusiones obtenidas aquí confirmaron la asociación informó de mutaciones de BRAF con características demográficas o clínico-patológicas específicas, lo que puede ser útil para la predicción de los subtipos de NSCLC combinados con mayor precisión con otros cambios genéticos.
Apoyo a la Información
Tabla S1. .
El análisis de subgrupos de la relación entre las características de la mutación BRAF y tumorales de acuerdo con el origen étnico y el número de mutaciones
doi: 10.1371 /journal.pone.0101354.s001 gratis (DOCX)
Lista de verificación S1.
PRISMA 2009 Lista de verificación
doi:. 10.1371 /journal.pone.0101354.s002 gratis (DOC)