Extracto
Antecedentes
El gen de TERT es el componente de la transcriptasa inversa de la telomerasa y es esencial para el mantenimiento de la longitud de los telómeros de ADN, la estabilidad cromosómica y la inmortalidad celular. CLPTM1L gen codifica una proteína relacionada con la resistencia a cisplatino, y está bien conservada y expresan en diversos tejidos normales o malignas, incluyendo cáncer de pulmón.
Métodos
Para probar esta hipótesis, genotipo significativa para dos SNPs terc-rs2736098 y rs4016981-CLPTM1L en un estudio de casos y controles con 501 casos de cáncer y 576 controles sin cáncer en población no fumadora chino. Se obtuvo información acerca de los factores demográficos y de riesgo de cada caso y el control mediante entrevista personal. polimorfismos de genes se determinaron mediante la metodología TaqMan.
Resultados
Hemos encontrado que el modelo genético variante homocigótica del gen de TERT se asoció con un aumento significativo del riesgo de cáncer de pulmón con OR ajustada de 1,72 (95% CI = 1,19-2,51,
P = 0,004
de heterogeneidad). El efecto conjunto de terc CLPTM1L y mayor riesgo de cáncer de pulmón con OR ajustada es (IC del 95% = 1,00 a 1,74,
P = 0,052
de heterogeneidad) 1.31.
Conclusión
las variantes genéticas en terc CLPTM1L y puede afectar a la susceptibilidad del cáncer de pulmón, especialmente el adenocarcinoma en mujeres no fumadoras Chinese
Visto:. Li C, Yin Z, W Wu, Li X, y Ren, Zhou B (2013 ) Las variaciones genéticas en genes terc-CLPTM1L y riesgo de cáncer de pulmón en las mujeres chinas no fumadores. PLoS ONE 8 (5): e64988. doi: 10.1371 /journal.pone.0064988
Editor: Graham R. Wallace, Universidad de Birmingham, Reino Unido
Recibido: 24 Octubre, 2012; Aceptado: April 19, 2013; Publicado: 30 de mayo de 2013
Derechos de Autor © 2013 Li et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Este estudio fue apoyado por no.81272293 beca de la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China, conceder no.81102194 de la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China, conceder no.LS2010168 de Liaoning Provincial del Departamento de Educación, y otorgar no.00726 de la Junta médica de China.
Conflicto de intereses:. los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Antecedentes
a nivel mundial, el cáncer es una de las causa más importante de muertes relacionadas con el cáncer. La mayoría de los tipos de cáncer se atribuyen al efecto de la interacción gen-ambiente. Un gran número de estudios se han centrado en el polimorfismo del gen y de la susceptibilidad al cáncer. Además de varios tipos de tumor heredado, casos más esporádicos es todavía indefinido. Los últimos estudios prestan atención a la telomerasa transcriptasa inversa (terc), labio leporino y paladar transmembrana 1-como variación (CLPTM1L) gen que locus en el cromosoma 5p15.33. Muchos estudios de asociación de genoma completo (GWAS) de cáncer han sido reportados y siempre que la región genómica de TERT-CLPTM1L asociado el riesgo de cáncer de pulmón. En la mayoría de los estudios, el principal de los casos y los controles eran fumadores de cigarrillos que hace que sea difícil juzgar si estos genes estaban asociados con el cáncer de pulmón o el uso de tabaco [1]. Por otra parte, una proporción sustancial de cáncer de pulmón en las mujeres asiáticas se produce entre los no fumadores, que curiosamente tienen una proporción relativamente alta de cáncer de rabia [2]. Por otra parte, el estudio anterior mostró la evidencia de que las asociaciones de polimorfismos genotipo con el riesgo de cáncer de pulmón podrían ser confundidos por género o fumar [3]. Por lo tanto, se realizó un estudio de asociación del genoma en las mujeres que nunca fumaban en la población china Han.
El gen de TERT es el componente de la transcriptasa inversa de la telomerasa y es esencial para el mantenimiento de la longitud de los telómeros de ADN, la estabilidad cromosómica y inmortalidad celular [4], [5]. Actividad de la telomerasa se encontró en 85% -90% de los cánceres humanos. Además, la longitud del telómero en la mayoría de los tumores se mantendría por el bien de la forma anormal expresa de la de los telómeros en las células malignas, tales como la mayoría de las células tumorales. Sin embargo, este fenómeno no han puesto de manifiesto en el tejido de la salud o células [6]. CLPTM1L gen codifica una proteína ligada a la resistencia a cisplatino hormiga que está bien conservada y expresan en diversos tejidos normales o malignas, como el pulmón de la piel, de mama, de ovario cervical [7].
Los estudios previos indicaron que el gen de TERT y CLPTM1L gen asociado con el riesgo de muchos tipos de cánceres. Recientemente, dos estudios de asociación de genoma completo han identificado la misma región susceptibles para el cáncer de pulmón. Entre estos sitios, los cuales rs2736098 en el gen locus de TERT se ha identificado la susceptibles. Al mismo tiempo, rs401681 están en una región de alta desequilibrio de ligamiento (LD) que incluye las regiones promotoras de TERT de y toda la región de codificación del gen CLPTM1L también reportados mucho. Para probar esta hipótesis, genotipo de dos SNPs significativos terc-rs2736098 y rs4016981-CLPTM1L en un estudio de casos y controles con 501 casos de cáncer y 576 controles sin cáncer en la población china no fumadores.
Materiales y Métodos
estudio Asunto
Se obtuvo la aprobación ética para nuestro estudio. El nombre del comité de ética es China Comité de Ética de la Universidad de Medicina. También subimos una renuncia formal por escrito de la aprobación ética para su sistema
.
Este fue un estudio de casos y controles de base hospitalaria en el noreste de China. Todos los sujetos eran no relacionados étnicos chinos Han. No hubo ninguna restricción de edad e histología de la contratación y los criterios de exclusión de los casos incluyen metástasis del cáncer, cáncer previo y radioterapia o quimioterapia previa. Un total de 501 casos de cánceres de pulmón se obtuvieron 2002-2010 en el Hospital primera Afiliado de la Universidad Médica de China y el estudio histopatológico confirmó el cáncer de Liaoning cáncer de pulmón primario. Los 576 controles sin cáncer fueron seleccionados del mismo hospital o la historia actual de la enfermedad maligna durante el mismo período que se reclutaron los casos y que fueron agrupados frecuencia sujetos a caso por edad (± 5 años). Controles sufrieron principalmente de la bronquitis, enfermedad pulmonar y enfisema. Todos los individuos incluidos en este estudio sólo se inscribieron después de proporcionar el consentimiento informado por escrito para participar.
Análisis Genotipo
ADN genómico fue extraído de un pellet de leucocitos mediante digestión con proteinasa K seguido de extracción con fenol-cloroformo y precipitación con etanol como se ha descrito previamente [8]. SNPs en tanto terc-rs2736098 y CLPTM1L-rs401681 se genotipo por los investigadores cegados al caso-control de estado con el fin de evitar cualquier sesgo de genotipado, utilizando la metodología TaqMan y leer con el software de detección de secuencias en un Applied Bio-systems 7500 RÁPIDO Real-Time PCR Sistema de acuerdo con las instrucciones del fabricante (Applied Biosystems, Foster City, CA). cebadores y sondas TaqMan PCR fueron suministrados por Applied Biosystems. Cada placa incluyó un control negativo (sin ADN), duplica los controles positivos comerciales (ADN genómico de control TaqMan; Applied Biosystems). La amplificación se realizó en las siguientes condiciones: 95 ° C durante 10 min seguido de 47 ciclos de 92 ° C durante 30 s y 60 ° C durante 1 min. Para validar los resultados de genotipado, 10% de las muestras seleccionadas al azar se duplicaron y todos duplicados fueron emparejados.
Análisis estadístico
Dos caras
x
2 se utilizó la prueba para examinar las diferencias en la distribución de las características demográficas, variables seleccionadas y genotipos entre los casos y controles. Las asociaciones de genotipos de t y CLPTM1L con el riesgo de cáncer de pulmón se estimaron mediante el cálculo de la odds ratio (OR) y su intervalo de confianza del 95% (IC) de los dos modelos de regresión logística univariante y multivariante en el análisis de casos y controles. El equilibrio de Hardy-Weinberg para cada SNP se puso a prueba con
x
2 la prueba de Pearson. Todos los análisis se realizaron con ajuste por edad y los ingresos y todos los individuos eran mujeres no fumadoras. Todas las pruebas fueron de dos caras, y P & lt; 0,05 se consideró significativo. Todos los análisis se realizaron utilizando el estadístico de productos y soluciones de servicio de software. (V.16.0; SPSS Instituto Cary, Chicago, IL)
Resultados
Los datos demográficos de los 501 casos de cáncer de pulmón y el cáncer 576 -free controles se presentan en la Tabla 1, con promedio de edad de los casos y controles (media ± dE) es casi idéntico (56,7 ± 11,6 y 56,2 ± 13,0 años, respectivamente). No hubo diferencia significativa en la edad entre los casos y los controles (
P
= 0,471). En él participaron 334 adenocarcinomas, 90 carcinomas de células escamosas y otros 77 tumores con una variedad de diferentes patologías (incluidos los de células grandes, carcinomas de células pequeñas y de células mixtas o carcinomas indiferenciados). Todos los individuos eran hembras no fumadores.
Las frecuencias genotípicas observadas entre los sujetos de control eran ambos de acuerdo con lo esperado bajo el equilibrio de Hardy-Weinberg (p
2 + 2pq + q
2 = 1,
P = 0,065
para rs2736098 y rs401681 0,463 para). Como se muestra en la Tabla 2, el alelo T rs2736098 en el gen de TERT se asoció con un aumento significativo del riesgo de cáncer de pulmón (
P = 0,009
de heterogeneidad), con OR ajustadas de 1,27 (IC del 95% = 1,06-1,52 ). Mientras tanto, pudimos observar un aumento de la asociación entre el polimorfismo rs2736098 y el riesgo de cáncer de pulmón en un modelo genético (TT vs CC: OR = 1,72, IC del 95% = 1,19 a 2,51,
P = 0,004
la heterogeneidad ). Además, cuando se combinaron los genotipos variantes (TT + TC) suponiendo un modelo genético dominante, los genotipos variantes combinadas aumentaron no significativamente la susceptibilidad de cáncer de pulmón. Sin embargo, ninguna asociación significativa se mostró entre cada modelo genético entre rs401681 en CLPTM1L y el riesgo de cáncer de pulmón. Luego se combinaron los dos SNPs para evaluar su efecto conjunto en el riesgo de cáncer de pulmón. Hemos clasificado todos los genotipos de cada SNP en las tres o dos grupos diferentes (tricotomizadas y dicotomizadas) de acuerdo con el número de genotipos variantes. Como se muestra en la Tabla 2, los grupos opuestos, los individuos con genotipos 2 variantes tenían un riesgo significativamente mayor de cáncer de pulmón, en comparación con los individuos con 0 o 1 genotipos variantes. La OR ajustada es (IC del 95% = 1,00 a 1,74,
P = 0,052
de heterogeneidad) 1.31.
La Tabla 3 resume la relación entre el terc-rs2736098 y rs401681-CLPTM1L genotipos de casos y controles de cáncer de pulmón, estratificado según la histología. El alelo T en rs2736098 del gen de TERT se asoció con un aumento significativo del riesgo de cáncer de pulmón en el subgrupo de adenocarcinoma (P & lt; 0,001 para la heterogeneidad), con OR ajustadas de 1,43 (IC 95% = 1,17-1,75). También se obtuvo una mayor asociación estadísticamente significativa entre el polimorfismo rs2736098 y el riesgo adencarcinoma en dos modelos genéticos (TT vs CC: OR = 2,17, IC del 95% = 1,44 a 3,25,
P Hotel & lt; 0,001 para la heterogeneidad; CT + CC versus CC: O IC = 1,40, 95% = 1,05 a 1,86,
P = 0,026
de heterogeneidad). También como se describe en la Tabla 3, C-alelo en CLPTM1L rs401681 aumenta el riesgo de adenocarcinoma de pulmón y de subgrupos del (IC del 95% = 1,00 a 1,52,
P = 0,046
de heterogeneidad) 1,23 OR ajustado es.
Discusión
Para nuestro conocimiento, este es el primer estudio que ha investigado si las dos variantes genéticas identificadas-GWAS (terc-rs2736098 y rs401681-CLPTM1L) en los locus son 5p5.33 asociado con el riesgo de cáncer de pulmón en no fumadores Han-chino hembras. Los resultados sugieren que el gen alelo variante de rs2736098 se asoció significativamente con un mayor riesgo de cáncer de pulmón, especialmente en el adenocarcinoma de pulmón. Por otro lado, nuestro estudio obtenido los datos sobre el aumento del riesgo de adenocarcinoma de pulmón y el alelo C en rs401681 del gen CLPTM1L, mientras que los otros modelos genéticos tenían ninguna asociación estadísticamente significativa con el cáncer de pulmón en mujeres no fumadoras.
La gen de tERT se ha mapeado en el cromosoma 5p15.33 y consistió de 16 exones y 15 intrones que abarcan 35kb de ADN genómico [9], rs2736098 se localiza en el segundo exón del gen de la telomerasa de tERT. proteína de TERT es una subunidad catalítica y un regulador clave de la actividad de la telomerasa. Por lo tanto, de TERT se considera que es un candidato más plausible en 5p15.33 para el riesgo de cáncer de pulmón [4]. La sobreexpresión de la actividad de TERT y de la telomerasa se ha observado en muchos tumores, como el cáncer de pulmón, cáncer de piel, glioma. Sin embargo, el significado funcional de los SNP rs2736098 no estaba claro y el mecanismo molecular por el que el polimorfismo afecta el riesgo de cáncer de pulmón todavía no se aclara. Nuestra investigación proporciona una fuerte evidencia de la población china que el 5p15.33 podría ser causal con la región de predisponer a la susceptibilidad al cáncer de pulmón, y el efecto de los SNP rs2736098 era la misma a la población coreana en Asia [10]. Hasta el momento, ninguno de los estudios en cuestión la relación entre rs2736098 en terc y cáncer de pulmón en población caucásica, aunque se encontró que la frecuencia de mutación del alelo en la población caucásica era 37% a través de HapMap, así como los datos de la población asiática fue 41% (http : //snp.cshl.org/cgi-perl/gbrowse/hapmap24_B36/). El gen CLPTM1L también localizado en el cromosoma 5p15.33 y puede desempeñar un papel en la respuesta apoptótica. Además, CLPTM1L también es un gen de susceptibilidad al cáncer de atractivo, ya que codifica una transcripción cuya sobreexpresión se ha relacionado con la resistencia a cisplatino [7]. La sobreexpresión de ARNm CLPTM1L se ha observado en muchos tipos de cáncer, incluyendo el cáncer de pulmón. La base en nuestros resultados, rs401681 alelo variante de t no contribuye al riesgo de cáncer de pulmón para las mujeres que no fuma. No obstante, cuando se estratificó por la patología, el alelo C en CLPTM1L-rs401681 aumenta el riesgo de adenocarcinoma de pulmón de subgrupos y el ajuste o no (IC del 95% = 1,00 a 1,52,
P = 0,046
de heterogeneidad) 1.23. Por lo tanto, nuestro estudio sugiere que los genotipos variantes CLPTM1L-rs401681 pueden desempeñar diferentes funciones en diferentes subgrupos de patología de cáncer de pulmón. Mirando hacia atrás en los estudios previos, los resultados que se han reportado fueron insatisfactorios e incluso contradictorios. Por ejemplo, un estudio inicial informó que los genotipos CLPTM1L T no se asociaron con el riesgo de cáncer de pulmón en una población caucásica [11]. Por otra parte, dos investigadores informaron que CLPTM1L polimorfismo del gen no se asoció con el riesgo de cáncer de pulmón en una población asiática [15], [16]. Ambos eran conjuntos de datos basados en el hospital. Sin embargo, ocho estudios de asociación mostraron que el alelo rs401681 ç marginalmente aumentaron los cánceres de pulmón general de riesgo tanto en un caucásico y una población asiática [3], [12], [17] - [22]. No hace mucho, un meta-análisis investigado por Yin et al. encontrado que los individuos con los genotipos alelo C tuvieron mayor riesgo de cáncer de pulmón [23]. A pesar de que el estudio, sorprendentemente se encontró un riesgo de cánceres relacionados con el tabaquismo, como el cáncer de pulmón. Se puede explicar que la proteína CLPTM1L puede estar implicada en la respuesta de apoptosis estrés genotóxico. La posible explicación de estas discrepancias podría ser que las frecuencias de los alelos en diferentes etnias eran muy diferentes. Los datos de HapMap demuestran que la frecuencia del alelo T en población caucásica fue 43%, pero los datos de la población asiática fue 29% (http://snp.cshl.org/cgi-perl/gbrowse/hapmap24_B36/). La diferencia podría también debido a la gran diferencia en cada uno de los tamaños de muestra. La mayor parte de los últimos estudios GWAS contenían más que diez mil casos, así como controles. Por el contrario, cuando se utiliza TaqMan o metodología de PCR-RFLP, las otras investigaciones contenían casi mil casos o sólo varios cientos de casos de cáncer. Por otra parte, las discrepancias podrían Debido a las diferentes fuentes de grupo de control o método de genotipificación. El funcional exacta de CLPTM1L sigue siendo poco clara. El estudio previo especula que puede ser fuerte en LD con otros SNPs funcionales o causales potenciales [7]. Adicionalmente, en una relación positiva entre el alelo C y rs401681 más corta longitud de los telómeros en relación sugiere que el gen CLPTM1L fue candidato en que afecta a la susceptibilidad al cáncer de pulmón [24]. Fue mismo a la terc-rs2736098. Además, la base en el efecto potencial entre interactúan de TERT y CLPTM1L, que clasifica todos los genotipos de cada SNP en dos grupos diferentes según el número de genotipos variantes. El modelo dicotomizar indicado que los individuos con genotipos 2 variantes tenían un riesgo significativamente mayor de cáncer de pulmón, en comparación con los individuos con genotipos 1 o 0 variantes.
terc-CLPTM1L región genómica han sido ampliamente estudia en muchos tipos de cáncer en diferentes poblaciones, pero los resultados son contradictorios. Gago-Domínguez et al. [13] encontró que el gen alelo variante en tanto terc-rs2736098 y rs401681-CLPTM1L se asociaron significativamente con un mayor riesgo de cáncer de vejiga entre la población china. Sin embargo, hubo falta de asociación entre polimorfismos de nucleótido único comunes en el locus del cáncer de mama y terc-CLPTM1L en los blancos no hispanos. También Chen et al. [14] informó de que homocigotos modelo genético variante de terc-rs2736098 mayor riesgo de glioma. Es de destacar que de terc-CLPTM1L región genómica entre la población asiática se ha relacionado con un mayor riesgo de varios tipos de cáncer. Por el contrario, la falta de estudios investigó otras etnias. Más evidencias deben ser proporcionados en el futuro con respecto a la asociación entre terc-CLPTM1L región genómica y el riesgo de cáncer en diferentes razas. Otros estudios que toman en consideración el análisis de subgrupos y el estrés ambiental en esta región son necesarias.
Conclusión
En conclusión, nuestro estudio reveló que el polimorfismo rs2736098 terc-puede aumentar el riesgo de cáncer de pulmón, especialmente en el adenocarcinoma de pulmón en mujeres no fumadoras en la población china. Por otra parte, C alelo en el gen CLPTM1L-rs401680 puede alterar el riesgo de adenocarcinoma de pulmón. Debido a que los polimorfismos genéticos a menudo varían entre los grupos étnicos, esta investigación podría ampliarse en bien diseñados estudios futuros en diversas mujeres de origen no fumadores.