Extracto
Antecedentes
ARN ribosomal (rRNA) es un regulador central del crecimiento celular y puede controlar el desarrollo del cáncer. Un rRNA cis no codificante (nc-rRNA) aguas arriba de la
45S rRNA
sitio de inicio de la transcripción Recientemente se ha implicado en el control de
rRNA
transcripción en fibroblastos de ratón. Hemos investigado si uno similar nc-rRNA podría expresarse en las células epiteliales de cáncer humano, y en relación con cualquier característica genómica.
Metodología /Principales conclusiones
Uso de la medición cuantitativa rRNA, hemos demostrado que un nc -rRNA se transcribe en las células epiteliales de pulmón y cáncer de pulmón humano, a partir de aproximadamente -1000 nucleótidos aguas arriba de la
rRNA
sitio de inicio de la transcripción (+1) y que se extiende al menos a 203. Este nc-rRNA fue significativamente más abundantes en la mayoría de las líneas celulares de cáncer de pulmón, con respecto a una línea celular epitelial de pulmón no transformado. Su abundancia negativamente correlacionada con el total de ARNr 45S en 12 de las 13 líneas celulares (P = 0,014). Durante el análisis de secuencia de -388 a 306, observamos diversos polimorfismos frecuentes, Intercopy de nucleótido único (SNP) en
rRNA
, con una frecuencia mayor que lo predicho aleatoriamente en 12 sitios. Un SNP en 139 (T /C) en la secuencia líder 5 'varió entre las líneas celulares y una correlación negativa con el nivel de la nc-rRNA (P = 0,014). Modelización de la estructura secundaria de la secuencia 5 'líder rRNA indicó un pequeño aumento en la estabilidad estructural debido a la 139 U /C SNP y un cambio menor en las ocurrencias de configuración local.
Conclusiones /Importancia
los resultados demuestran la aparición de un sentido nc-ARNr en las células epiteliales de pulmón y cáncer humano, e implican un papel en la regulación de la
rRNA
gen, que puede ser afectado por un 139 SNP en el 5 "secuencia líder de la transcripción del ARNr primaria
Visto:. Shiao YH, Lupascu ST, Gu YD, Kasprzak W, Hwang CJ, campos JR, et al. (2009) Un intergénica no codificante de ARNr correlacionada con la expresión de la
rRNA Opiniones y frecuencia de un
rRNA
polimorfismo de nucleótido único en células de cáncer de pulmón. PLoS ONE 4 (10): E7505. doi: 10.1371 /journal.pone.0007505
Editor: Anita Brandstaetter, Universidad Médica de Innsbruck, Austria