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PLOS ONE: un enfoque para la identificación de objetivos específicos de metástasis en los huesos gracias a los genes del cáncer interactoma y ontología análisis de genes


Extracto

La metástasis es uno de los aspectos más enigmáticos de la patogénesis del cáncer y es una causa importante de mortalidad asociada al cáncer. cáncer de hueso Secundaria (SBC) es una enfermedad compleja causada por metástasis de las células tumorales de su sitio primario y se caracteriza por intrincada interacción de las interacciones moleculares. Identificación de objetivos para las enfermedades multifactoriales tales como SBC, la complicación más frecuente de los cánceres de mama y de próstata, es un desafío. Hacia el logro de nuestro objetivo de identificación de objetivos específicos para la CBS, se construyó un 'cáncer Genes Red', una proteína interactoma representante de los genes del cáncer. El uso de métodos teóricos gráfico, se obtuvo un conjunto de genes clave que son relevantes para los mecanismos genéricos de cáncer y que tienen un papel en la esencialidad biológica. También hemos recopilado un conjunto de datos curada de 391 genes SBC de la literatura publicada, que sirve como base de correlatos ontológicos de cáncer de huesos secundario. Sobre la base de estos resultados, se implementa una estrategia basada en los genes del cáncer genéricos, genes SBC y método de enriquecimiento de ontología de genes, para obtener un conjunto de objetivos que son específicos de metástasis ósea. A través de este estudio, se presenta un método para sondear una de las principales complicaciones en los cánceres, a saber, la metástasis. Los resultados en los genes que juegan papeles genéricos en el fenotipo del cáncer, obtenidos mediante el análisis de redes de genes cancerígenos 'red', tienen amplias implicaciones en la comprensión del papel de los reguladores moleculares en los mecanismos de cánceres. En concreto, nuestro estudio proporciona un conjunto de objetivos potenciales que son de relevancia ontológica y regulatorio para el cáncer de huesos secundario

Visto:. Vashisht S, bagler G (2012) Un enfoque para la identificación de objetivos específicos de metástasis en los huesos Uso Los genes de cáncer Interactome y análisis de genes Ontología. PLoS ONE 7 (11): e49401. doi: 10.1371 /journal.pone.0049401

Editor: Matthias Dehmer, UMIT, Austria

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