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PLOS ONE: Evaluación de la Asociación de HNF1B variantes con cánceres diversas: Análisis de Colaboración de datos de los estudios de asociación de genoma completo 19


Extracto

Antecedentes
estudios de asociación
genoma completo han encontrado variantes de tipo 2 asociada a la diabetes en el
HNF1B
gen para exhibir las asociaciones de reciprocidad con el riesgo de cáncer de próstata. El objetivo fue determinar si estas variantes pueden tener un efecto sobre el riesgo de cáncer en general, frente a un efecto específico sobre el cáncer de próstata solamente.

Metodología /Principales conclusiones

En un análisis conjunto, se recogieron datos de GWAS de fenotipos de cáncer para la frecuencia informó variantes de
HNF1B
, rs4430796 y rs7501939, que están en desequilibrio de ligamiento (r
2 = 0,76, HapMap CEU). En general, el análisis incluyó 16 conjuntos de datos sobre rs4430796 con 19.640 casos de cáncer y 21,929 controles; y 21 conjuntos de datos sobre rs7501939 con 26,923 casos y 49,085 controles. Neoplasias distintas al cáncer de próstata incluyen colorrectal, de mama, de pulmón y cánceres de páncreas y melanoma. El metanálisis mostró una amplia heterogeneidad entre conjunto de datos que fue impulsado por diferentes efectos en el cáncer de próstata y otros cánceres. El odds ratio per-DT2 riesgo de alelo (95% intervalo de confianza) para rs4430796 fueron 0,79 (0,76; 0,83)] por alelo G para el cáncer de próstata (p & lt; 10
-15 para ambos); y 1,03 (0,99, 1,07) para todos los otros tipos de cáncer. Del mismo modo para rs7501939 los odds ratios per-DT2 riesgo de alelo (intervalos de confianza del 95%) fueron 0,80 (0,77, 0,83) por cada alelo T para el cáncer de próstata (p & lt; 10
-15 para ambos); y 1,00 (0,97, 1,04) para todos los otros tipos de cáncer. No se aparte de malignidad del cáncer de próstata tenían una asociación estadísticamente significativa nominalmente.

Conclusiones /Importancia

Los
examinados HNF1B
variantes tienen un efecto altamente específica sobre el riesgo de cáncer de próstata sin aparente asociación con cualquiera de los otros tipos de cáncer estudiados

Visto:. Elliott KS, Zeggini E, MI McCarthy, Gudmundsson J, P Sulem, Stacey SN, et al. (2010) Evaluación de la Asociación de
HNF1B
variantes con diversos tipos de cáncer: Análisis de Colaboración de datos de 19 estudios de asociación de genoma completo. PLoS ONE 5 (5): e10858. doi: 10.1371 /journal.pone.0010858

Editor: Florian Kronenberg, Universidad Médica de Innsbruck, Austria

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