Extracto
adenocarcinoma pancreático (PAC) es uno de los más difíciles de tratar tumores. Gran parte de esto se atribuye al diagnóstico tardío. Para identificar biomarcadores para la detección precoz, se examinaron las diferencias de metilación del ADN en el ADN de leucocitos entre los casos y controles PAC en un estudio de dos fases. En la fase I, que mide los niveles de metilación en 1.505 sitios CpG en el ADN de leucocitos tratamiento previo de 132 pacientes no fumadores PAC y 60 controles sanos no fumadores. Se encontraron diferencias significativas en 110 sitios CpG (falso descubrimiento tasa y lt; 0,05). En la fase II, hemos probado y validado 88 de 96 fases que he seleccionado sitios CpG en 240 casos PAC y 240 controles emparejados (p≤0.05). El uso de regresión logística penalizado, se construyó un modelo de predicción que consiste en cinco sitios CpG (IL10_P348, LCN2_P86, ZAP70_P220, AIM2_P624, TAL1_P817), capaz de discriminar pacientes de APA de los controles (C-estadística = 0,85 en la fase I; 0,76 en la fase II). Curiosamente, un sitio CpG (LCN2_P86) por sí sola podría discriminar a los pacientes resecables derivadas de los controles (C-estadística = 0,78 en la fase I; 0,74 en la fase II). También se realizó el análisis de metilación loci de rasgos cuantitativos (methQTL) y se identificaron tres sitios CpG (AGXT_P180_F, ALOX12_E85_R, JAK3_P1075_R), donde los niveles de metilación se asociaron significativamente con los polimorfismos de nucleótido único (SNPs) (tasa de falso descubrimiento & lt; 0,05). Nuestros resultados demuestran que la variación epigenética en el ADN de leucocitos fácilmente obtenible, que se manifiesta por diferencias de metilación reproducibles, puede ser utilizado para detectar pacientes de APA. Las diferencias de metilación en ciertos sitios CpG son atribuibles parcialmente a la variación genética. Este estudio apoya firmemente el futuro estudio de asociación del epigenoma usando ADN de leucocitos para el descubrimiento de biomarcadores en enfermedades humanas
Visto:. Pedersen KS, Bamlet WR, Oberg AL, de Andrade M, Matsumoto ME, Tang H, et al. (2011) de leucocitos metilación del ADN Firma Diferencia cáncer pancreático Los pacientes de los controles sanos. PLoS ONE 6 (3): e18223. doi: 10.1371 /journal.pone.0018223
Editor: Hana Algül, Technische Universität München, Alemania