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PLOS ONE: Una estrategia computacional para seleccionar objetivos proteicos Optimizado para el desarrollo de fármacos hacia el control de las enfermedades de cáncer


Extracto

En este informe se describe una estrategia para la selección óptima de objetivos proteicos adecuados para el desarrollo de fármacos contra las enfermedades neoplásicas que toman el caso particular del cáncer de mama como un ejemplo. Se combinaron los datos interactome y transcriptoma humano a partir de líneas de células malignas y control porque se espera que las proteínas altamente conectadas que están regulados en marcha de líneas de células malignas que ser objetivos proteicos adecuados para la quimioterapia con una menor tasa de efectos secundarios indeseables. Hemos normalizado de datos del transcriptoma y se aplicó un tratamiento estadístico para extraer de manera objetiva las subredes de abajo y hasta reguladas genes cuyas proteínas interactuar eficazmente. Elegimos los más conectados los que actúan como concentradores de proteínas, más bienestar en la red de señalización. Se demuestra que las proteínas diana con eficacia identificados por la combinación de la conectividad de la proteína y la expresión diferencial se conocen como dianas adecuadas para la quimioterapia con éxito de cáncer de mama. Curiosamente, encontramos proteínas adicionales, por lo general no dirigidos por los tratamientos con fármacos, que podrían justificar la extensión de la formulación existente mediante la adición de inhibidores diseñados contra estas proteínas con la consecuencia de mejorar los resultados terapéuticos. Las alteraciones moleculares observados en líneas celulares de cáncer de mama representa a ninguna de eventos conductor y /o vías de controladores que son necesarios para el desarrollo del cáncer de mama o de progresión. Sin embargo, es evidente que la señalización de los mecanismos de la luminal A, B y subtipos triple negativos son diferentes. Por otra parte, las redes hacia arriba y hacia abajo regulados predijeron objetivos farmacológicos subtipo específico y las posibles circuitos de compensación entre los genes regulados hacia arriba y hacia abajo. Creemos que estos resultados pueden tener implicaciones clínicas importantes en el tratamiento personalizado de pacientes con cáncer que permiten un enfoque objetivo para el reciclado del arsenal de fármacos disponibles para el caso específico de cada cáncer de mama debido a sus distintas características moleculares cualitativos y cuantitativos.

Visto: Carels N, T Tilli, Tuszynski JA (2015) Una estrategia computacional para seleccionar objetivos proteicos Optimizado para el desarrollo de fármacos hacia el control de las enfermedades de cáncer. PLoS ONE 10 (1): e0115054. doi: 10.1371 /journal.pone.0115054

Editor Académico: Pranela Rameshwar, Escuela de Rutgers-New Jersey Médico, Estados Unidos

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