microRNAs
Extracto
Introducción
Un creciente número de estudios han investigado (miRNAs) como posibles marcadores de diagnóstico, tratamiento y pronóstico. Hasta el momento, el acuerdo entre los estudios ha sido mínima, lo que en parte explicarse por la heterogeneidad intratumoral de expresión de miARN. El objetivo del presente estudio fue evaluar la heterogeneidad de un panel de miRNAs seleccionados en el cáncer de recto, utilizando dos enfoques diferentes técnicas.
Materiales y Métodos
Se analizó la expresión de los miARN investigados por reacción en tiempo real en cadena de polimerasa cuantitativa (RT-qPCR) y
in situ
hibridación (ISH) en muestras tumorales de 27 pacientes con cáncer de recto T3-4. A partir de cada tumor, se examinó el tejido de tres localizaciones diferentes luminales. la variabilidad inter e intra-paciente se evaluó mediante el cálculo de los coeficientes de correlación intraclase (CCI). Las correlaciones entre la RT-qPCR e ISH se evaluaron mediante la correlación de Spearman.
Resultados
CPI
simple (una muestra de cada paciente) fue mayor que el 50% de los genes miARN-21 y miRNA- 31. Para miRNA-125 ter, miRNA-145, y miRNA-630, CPI
single fue inferior al 50%. La CPI
significa (media de tres muestras de cada paciente) fue mayor que el 50% de los genes miARN-21 (RT-qPCR e ISH), miRNA-125 ter (RT-qPCR e ISH), miRNA-145 (ISH), miRNA-630 (RT-qPCR), y los genes miARN-31 (RT-qPCR). Para miRNA-145 (RT-qPCR) y miRNA-630 (ISH), CPI
media fue inferior al 50%. Los coeficientes de correlación de Spearman, comparando los resultados obtenidos por RT-qPCR e ISH, respectivamente, variaron desde 0,084 hasta 0,325 para el valor medio de cada paciente, y -0,085-,515 en la sección que incluye la parte más profunda del tumor.
Conclusión
heterogeneidad intratumoral puede influir en la medición de la expresión de los genes miARN y en consecuencia el número de muestras necesarias para estimaciones representativas. Nuestros resultados con dos métodos diferentes sugieren que una muestra es suficiente para la evaluación adecuada de los genes miARN-21 y miRNA-31, mientras que más muestras mejorarían la evaluación de miRNA-125 ter, miRNA-145, y miRNA-630. Curiosamente, encontramos una pobre correlación entre las estimaciones de expresión obtenidos por RT-qPCR e ISH, respectivamente
Visto:. Eriksen AHM, Andersen RF, Nielsen BS, Sørensen FB, Appelt AL, Jakobsen A, et al. (2016) La heterogeneidad intratumoral de microARN de expresión en cáncer rectal. PLoS ONE 11 (6): e0156919. doi: 10.1371 /journal.pone.0156919
Editor: Rajvir Dahiya, UCSF /VA Medical Center, Estados Unidos